RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa14.27□□□□□ -0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa14.27□□□□□ -0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 F8VVB4 439 aa14.27□□□□□ -0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 F8VWA3 439 aa14.27□□□□□ -0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 H3BUI4 141 aa14.27□□□□□ -0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 TPPPO94811 219 aa14.27□□□□□ -0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM90A15PP0C7V4 464 aa14.27□□□□□ -0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM90A13PP0C7W8 464 aa14.27□□□□□ -0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM90A14PP0C7W9 464 aa14.27□□□□□ -0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM90A24PP0C7X0 464 aa14.27□□□□□ -0.12
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SMIM21Q3B7S5 101 aa14.27□□□□□ -0.12
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TOP3BP1-201ENST00000420768 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa14.27□□□□□ -0.12
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.27□□□□□ -0.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 COL12A1Q99715 3063 aa14.26□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 XRCC3O43542 346 aa14.26□□□□□ -0.13
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM178BH3BS89 294 aa14.25□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB27BO00194 218 aa14.25□□□□□ -0.13
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KNG1P01042 644 aa14.25□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDK2P24941 298 aa14.25□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.25□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 NR4A2P43354 598 aa14.25□□□□□ -0.13
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TOP3BP1-201ENST00000420768 EFNA4P52798 201 aa14.25□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF45Q02386 682 aa14.25□□□□□ -0.13
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF787Q6DD87 383 aa14.25□□□□□ -0.13
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa14.25□□□□□ -0.13
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TOP3BP1-201ENST00000420768 WNT9BO14905 357 aa14.24□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 FSTL3O95633 263 aa14.24□□□□□ -0.13
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MNDAP41218 407 aa14.24□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARL6IP1Q15041 203 aa14.24□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAF9Q16594 264 aa14.24□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 SOSTQ9BQB4 213 aa14.24□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFT22Q9H7X7 185 aa14.24□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.24□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.24□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 TREM2Q9NZC2 230 aa14.24□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 NLKQ9UBE8 527 aa14.24□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.24□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 CACNG2Q9Y698 323 aa14.24□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0A6YYD4 124 aa14.23□□□□□ -0.13
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SH2D1BO14796 132 aa14.23□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 DAOP14920 347 aa14.23□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 EGR1P18146 543 aa14.23□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 GABRR1P24046 479 aa14.23□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 GMFBP60983 142 aa14.23□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 PITPNAQ00169 270 aa14.23□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 MICBQ29980 383 aa14.23□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.23□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.23□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB3CQ96E17 227 aa14.23□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.23□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL36RNQ9UBH0 155 aa14.23□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSF4Q9ULV5 492 aa14.23□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 V9GYH0 126 aa14.23□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 TENM4Q6N022 2769 aa14.23□□□□□ -0.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPIAL4EA0A075B759 164 aa14.22□□□□□ -0.13
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