RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 ATAD3CQ5T2N8 411 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 C20orf204Q6ZNR8 217 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZTK2 550 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 DTX2Q86UW9 622 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 SNX29P2Q8IUI4 249 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 BORCS5Q969J3 196 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 RAB3CQ96E17 227 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 Q96M66 194 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 TM2D1Q9BX74 207 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CACNG6Q9BXT2 260 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 GCM1Q9NP62 436 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 NPTNQ9Y639 398 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 RTTNQ86VV8 2226 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 A0A0G2JMP0 313 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 A0A0X1KG70 313 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FAM90A10PA6NDY2 464 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FAM90A18PA6NE21 464 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FAM90A16PA6NEW6 464 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FAM90A7PA6NKC0 464 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FAM90A22PA8MWA6 464 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FAM90A12PA8MX19 464 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 SH2D1BO14796 132 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 TPPPO94811 219 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 SOD3P08294 240 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FAM90A15PP0C7V4 464 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FAM90A13PP0C7W8 464 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FAM90A14PP0C7W9 464 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FAM90A24PP0C7X0 464 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 DANCRP0C864 163 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 IL13RA2Q14627 380 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 TAF9Q16594 264 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 HFEQ30201 348 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 PIGYQ3MUY2 71 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 SPIN3Q5JUX0 258 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 C16orf87Q6PH81 154 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 C11orf53Q8IXP5 236 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 OR8H2Q8N162 312 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 GDPD1Q8N9F7 314 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 Q8NFD4 153 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 OR4M2Q8NGB6 313 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 NRIP2Q9BQI9 281 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 NICN1Q9BSH3 213 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 TREM2Q9NZC2 230 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 OR14J1Q9UGF5 321 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 V9GYH0 126 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FASNP49327 2511 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 TANC2Q9HCD6 1990 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 PRR14LQ5THK1 2151 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1W2PPR1 153 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FAM221AA4D161 298 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 SRRM5B3KS81 715 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 MCRIP1C9JLW8 97 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 DEGS1O15121 323 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 SOCS1O15524 211 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 INHBBP09529 407 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF44P15621 663 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CFHR2P36980 270 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 ARFRP1Q13795 201 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF181Q2M3W8 571 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CDNFQ49AH0 187 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 NHLRC3Q5JS37 347 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 NKAPLQ5M9Q1 402 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 TRIQKQ629K1 86 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 C11orf71Q6IPW1 123 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 ACP7Q6ZNF0 438 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 MFSD4AQ8N468 514 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 Q8TCH9 128 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 NEK7Q8TDX7 302 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FCAMRQ8WWV6 532 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CCL17Q92583 94 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC32Q9BV29 185 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 SPACA1Q9HBV2 294 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 MYO18BQ8IUG5 2567 aa10.27□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 DYSFO75923 2080 aa10.27□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 F8VVB4 439 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 F8VWA3 439 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 H7C417 338 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 J3QRK9 145 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 RAB27BO00194 218 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 WNT9BO14905 357 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CTDSPLO15194 276 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PDCD6O75340 191 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 KNG1P01042 644 aa10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms