RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 NEK6Q9HC98 313 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 MMP26Q9NRE1 261 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 CKLFQ9UBR5 152 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF222Q9UK12 451 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 MAB21L2Q9Y586 359 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 NF1P21359 2839 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 CUBNO60494 3623 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1W2PP11 408 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 TRAPPC2LH3BP13 241 aa7.56□□□□□ -1.2
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PDE4D-201ENST00000309641 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 CALRP27797 417 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 PTGFRP43088 359 aa7.56□□□□□ -1.2
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PDE4D-201ENST00000309641 IKZF1Q13422 519 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 PDCD1Q15116 288 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 DGUOKQ16854 277 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 C22orf42Q6IC83 251 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 C1orf159Q96HA4 380 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 GAFA1Q96PS6 74 aa7.56□□□□□ -1.2
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PDE4D-201ENST00000309641 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 MIOXQ9UGB7 285 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 SMIM30A4D0T7 59 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 DVL1O14640 695 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 MAGEB3O15480 346 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 MSMBP08118 114 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 GADD45AP24522 165 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 PITPNBP48739 271 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 BIVMQ86UB2 503 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 MKXQ8IYA7 352 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 RAB39BQ96DA2 213 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 CYYR1Q96J86 154 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 KCNK15Q9H427 330 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 B4DSR2 109 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 C22orf46C9J442 243 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 CD5LO43866 347 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 KDM4BO94953 1096 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 CD36P16671 472 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 PRKACAP17612 351 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 PRDX2P32119 198 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 GZMKP49863 264 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 OR10A3P58181 314 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 TRAM1Q15629 374 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 ESCO2Q56NI9 601 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 OR8B2Q96RD0 313 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 HMG20AQ9NP66 347 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 RASL12Q9NYN1 266 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 KAAG1Q9UBP8 84 aa7.55□□□□□ -1.2
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PDE4D-201ENST00000309641 AVPP01185 164 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 HEXAP06865 529 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 TGFBR1P36897 503 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 GNB2P62879 340 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 PAX2Q02962 417 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 KCNJ8Q15842 424 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 ASCL4Q6XD76 172 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 PXT1Q8NFP0 134 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 PHYHIPQ92561 330 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 THRSPQ92748 146 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 CENPOQ9BU64 300 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 CLN8Q9UBY8 286 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 STUB1Q9UNE7 303 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 ING4Q9UNL4 249 aa7.54□□□□□ -1.2
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