RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 NAXEQ8NCW5 288 aa21.58■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa21.58■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 SUSD2Q9UGT4 822 aa21.58■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 A8MVM7 634 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 MPIG6BO95866 241 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 IL18BPO95998 194 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 SRP19P09132 144 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 GALNSP34059 522 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 FMODQ06828 376 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 EHFQ9NZC4 300 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 LMO7DNF2Z398 122 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 OPN1LWP04000 364 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 CHRM2P08172 466 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 PGA4P0DJD7 388 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 PGA5P0DJD9 388 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 GIMD1P0DJR0 217 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 TDGF1P13385 188 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 BCKDHBP21953 392 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM50BP56557 158 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 RND3P61587 244 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 FAM210BQ96KR6 192 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 MMACHCQ9Y4U1 282 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 E5RGE8 158 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 DVL1O14640 695 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 MBP02144 154 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 MBPP02686 304 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 LINC00346Q8IVM7 164 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 C5orf34Q96MH7 638 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 BANF2Q9H503 90 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 NSG2Q9Y328 171 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 RFNGQ9Y644 331 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 XRCC2O43543 280 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 RPL27P61353 136 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 COPS7AQ9UBW8 275 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 CBY1Q9Y3M2 126 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 MARCH11A6NNE9 402 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 ALG1L2C9J202 215 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 CD200P41217 278 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 ARFRP1Q13795 201 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 TVP23CQ96ET8 276 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 NUDT22Q9BRQ3 303 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 FBLN5Q9UBX5 448 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 VDAC3Q9Y277 283 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 IFNA21P01568 189 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 PGCP20142 388 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 SLC6A8P48029 635 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.042e-6■■□□□ 13.2
PKDCC-201ENST00000294964 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 SGPP2Q8IWX5 399 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 SRPK3Q9UPE1 567 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 A0A1W2PP11 408 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 GPR137BO60478 399 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 FBXW4P57775 412 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 SLC10A1Q14973 349 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 OR1N1Q8NGS0 311 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 SNHG12Q9BXW3 62 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 LIPGQ9Y5X9 500 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 FREM2Q5SZK8 3169 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 SOX15O60248 233 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 PCP4P48539 62 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 SPSB3Q6PJ21 355 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 FTCDNL1E5RQL4 147 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 SNU13P55769 128 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 DCXRQ7Z4W1 244 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF519Q8TB69 540 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 PITPNC1Q9UKF7 332 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 CDRT15L2A8MXV6 281 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 PIAS2O75928 621 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 DIRAS3O95661 229 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 AMBPP02760 352 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 SGCBQ16585 318 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 C1orf210Q8IVY1 113 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 PLPP5Q8NEB5 264 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 LAMTOR5O43504 91 aa21.52■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 RAB4AP20338 218 aa21.52■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 NXPH1P58417 271 aa21.52■■□□□ 1.04
PKDCC-201ENST00000294964 ACY1Q03154 408 aa21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms