RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621271.4

CLTCL1-211, Transcript of clathrin heavy chain like 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTCL1, Length 5,313 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1-211ENST00000621271 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 SNRPGP15A8MWD9 76 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 LRP3O75074 770 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 SEMA7AO75326 666 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 SNCGO76070 127 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 BHLHA9Q7RTU4 235 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 BAGE3Q86Y29 109 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 BAGE2Q86Y30 109 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 OR10Z1Q8NGY1 313 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 OR4F5Q8NH21 305 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 OR4F4Q96R69 305 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 DOCK1Q14185 1865 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 H0Y8G0 127 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 CCSO14618 274 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 RGS13O14921 159 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 SLC25A6P12236 298 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 HRH1P35367 487 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 DIRC2Q96SL1 478 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 ICAM5Q9UMF0 924 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 FOXJ3Q9UPW0 622 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 A0A1W2PQD3 144 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 PLPP3O14495 311 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 MOSPD3O75425 235 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 CT62P0C5K7 136 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 FBXW9Q5XUX1 488 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 CBLN3Q6UW01 205 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 PCGF1Q9BSM1 259 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.69□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 MT-ND4LP03901 98 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 PI3P19957 117 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 KIR2DS2P43631 304 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 KISS1Q15726 138 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 DEGS2Q6QHC5 323 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 ZNF683Q8IZ20 524 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 EPOPA6NHQ4 379 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 FGF2P09038 288 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 CD96P40200 585 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 BATFQ16520 125 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 Q3ZCU0 254 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 LFNGQ8NES3 379 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 MRGPRDQ8TDS7 321 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 C14orf79Q96F83 325 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 TAF9BQ9HBM6 251 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 KPTNQ9Y664 436 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 ANKRD34CP0C6C1 535 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 AKR1C3P42330 323 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 PDCD1Q15116 288 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 ZIC1Q15915 447 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 KCNMB1Q16558 191 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 OR4S1Q8NGB4 309 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 ABHD3Q8WU67 409 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 ZNF665Q9H7R5 613 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 SIGLEC7Q9Y286 467 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 PRSS23O95084 383 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 SEMG1P04279 462 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 SULT1A3P0DMM9 295 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 SULT1A4P0DMN0 295 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 MAGEB1P43366 347 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 TNXAQ16473 311 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 YIPF5Q969M3 257 aa8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.67□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 DBX1A6NMT0 343 aa8.67□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 AHRRA9YTQ3 701 aa8.67□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 MS4A18H0YCH9 400 aa8.67□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 LANCL1O43813 399 aa8.67□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 AQP8O94778 261 aa8.67□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.67□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 LIFP15018 202 aa8.67□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 BAMBIQ13145 260 aa8.67□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 TGIF1Q15583 401 aa8.67□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 MS4A18Q3C1V0 323 aa8.67□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.67□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 CDH26Q8IXH8 852 aa8.67□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 LHX4Q969G2 390 aa8.67□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.67□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CLTCL1-211ENST00000621271 AK3Q9UIJ7 227 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms