RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601247.5

FCHO1-235, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 458 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-235ENST00000601247 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 TMEM59Q9BXS4 323 aa12.91□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 RASL12Q9NYN1 266 aa12.91□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 TREM2Q9NZC2 230 aa12.91□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 OR5V1Q9UGF6 321 aa12.91□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 RAB22AQ9UL26 194 aa12.91□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 PEX16Q9Y5Y5 336 aa12.91□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 NPTNQ9Y639 398 aa12.91□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 A3GALT2U3KPV4 340 aa12.91□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 LRRK2Q5S007 2527 aa12.91□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 PAHP00439 452 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 PGA5P0DJD9 388 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 VSIG8P0DPA2 414 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 DAOP14920 347 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 MGMTP16455 207 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 RAB6AP20340 208 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 DNASE1P24855 282 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 TALDO1P37837 337 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 EFNA4P52798 201 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 CARTPTQ16568 116 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF181Q2M3W8 571 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 UBE2NLQ5JXB2 153 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 ASCL4Q6XD76 172 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 C1QL2Q7Z5L3 287 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 BATF2Q8N1L9 274 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 TIMD4Q96H15 378 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF488Q96MN9 340 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 SELENOIQ9C0D9 397 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 BANF2Q9H503 90 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 TMEM106BQ9NUM4 274 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 MTCH1Q9NZJ7 389 aa12.9□□□□□ -0.34
FCHO1-235ENST00000601247 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 CLDN25C9JDP6 229 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 H3BUI4 141 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 CLPXO76031 633 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 SCGNO76038 276 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 F12P00748 615 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 IGKV1D-12P01611 117 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 CFHR2P36980 270 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 SNU13P55769 128 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 FGF12P61328 243 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 SPRNQ5BIV9 151 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 OR10K2Q6IF99 312 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 CRIP3Q6Q6R5 217 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 CDH24Q86UP0 819 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 C11orf53Q8IXP5 236 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 OR51T1Q8NGJ9 327 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 RAB40AQ8WXH6 277 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 PTX4Q96A99 478 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 CMTM3Q96MX0 182 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 GAL3ST1Q99999 423 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 NRIP2Q9BQI9 281 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 ATG5Q9H1Y0 275 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 RHBDL2Q9NX52 303 aa12.89□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 TMEM14DPA8MWL7 114 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 SRRM5B3KS81 715 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 OVOL3O00110 214 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 HPGDSO60760 199 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 CPT2P23786 658 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 CD80P33681 288 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 NPBWR2P48146 333 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 KCNJ8Q15842 424 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 ELP2Q6IA86 826 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 OR56B1Q8NGI3 324 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 OR5H6Q8NGV6 325 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 KCNK15Q9H427 330 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 HMG20AQ9NP66 347 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 DIABLOQ9NR28 239 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 FBLN5Q9UBX5 448 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 ST3GAL6Q9Y274 331 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 PPIAL4EA0A075B759 164 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 PPIAL4DF5H284 164 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 TMEM178BH3BS89 294 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 APOA1P02647 267 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 SFTPBP07988 381 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 PPIAL4FP0DN26 164 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 GABRR1P24046 479 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 PMELP40967 661 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 PITPNBP48739 271 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 ATP5J2P56134 94 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 MICBQ29980 383 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 SPIN3Q5JUX0 258 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 RAB12Q6IQ22 244 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 ACP7Q6ZNF0 438 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 LINC00596Q86U02 117 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-235ENST00000601247 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms