RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf100Q5SVJ3 147 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 AVPI1Q5T686 147 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB37Q5TC79 503 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 AGAP6Q5VW22 663 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 AWAT2Q6E213 333 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM166AQ6J272 317 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 FGFRL1Q8N441 504 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC54Q8NEL0 328 aa5.08□□□□□ -1.6
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CAPNS1-208ENST00000589162 OR5A2Q8NGI9 324 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 MCFD2Q8NI22 146 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC29Q8WV35 223 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A46Q96AG3 418 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 MICU1Q9BPX6 476 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 NICN1Q9BSH3 213 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 MIXL1Q9H2W2 232 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SMURF1Q9HCE7 757 aa5.08□□□□□ -1.6
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CAPNS1-208ENST00000589162 DUX4Q9UBX2 424 aa5.08□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0A6YYD4 124 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GWJ7 208 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
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CAPNS1-208ENST00000589162 VSTM5A8MXK1 200 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 J3QT63 122 aa5.07□□□□□ -1.6
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CAPNS1-208ENST00000589162 SELLP14151 372 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TUBG1P23258 451 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CD200P41217 278 aa5.07□□□□□ -1.6
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CAPNS1-208ENST00000589162 UNC119Q13432 240 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PIGYQ3MUY2 71 aa5.07□□□□□ -1.6
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CAPNS1-208ENST00000589162 GLT8D1Q68CQ7 371 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR82Q6UXN9 313 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT74Q7RTS7 529 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 C5orf24Q7Z6I8 188 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DTX2Q86UW9 622 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TPRA1Q86W33 373 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 LAX1Q8IWV1 398 aa5.07□□□□□ -1.6
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CAPNS1-208ENST00000589162 AQP3Q92482 292 aa5.07□□□□□ -1.6
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CAPNS1-208ENST00000589162 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
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CAPNS1-208ENST00000589162 SPSB1Q96BD6 273 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM3DQ96BQ1 224 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 C10orf35Q96D05 121 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A38Q96DW6 304 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CCL19Q99731 98 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 NARFLQ9H6Q4 476 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 LIN7BQ9HAP6 207 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 GCM1Q9NP62 436 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCB9Q9NP78 766 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TUBG2Q9NRH3 451 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DECR2Q9NUI1 292 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ING3Q9NXR8 418 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFA13Q9P0J0 144 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 DYSFO75923 2080 aa5.07□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CACNA1DQ01668 2161 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 TANC2Q9HCD6 1990 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ICE1Q9Y2F5 2266 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A075B6Q4 140 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM25AB3EWG3 89 aa5.06□□□□□ -1.6
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CAPNS1-208ENST00000589162 FAM25GB3EWG6 89 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 AIPO00170 330 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SIRPB1O00241 398 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 HSPB6O14558 160 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 LDLRAD4O15165 306 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 RGS5O15539 181 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 SSX4O60224 188 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV4-39P01824 125 aa5.06□□□□□ -1.6
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