RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF649Q9BS31 505 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 GORASP2Q9H8Y8 452 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF222Q9UK12 451 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 TENM2Q9NT68 2774 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0G2JND7 137 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ODF3BA8MYP8 253 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 SLC1A7O00341 560 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CST4P01036 141 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 PRKACBP22694 351 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 FMO3P31513 532 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 DCTDP32321 178 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 DYNLT3P51808 116 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ARHGDIBP52566 201 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 SSTP61278 116 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF273Q14593 569 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CALHM1Q8IU99 346 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF561Q8N587 486 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 FAM86B1Q8N7N1 296 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 OR52H1Q8NGJ2 320 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF671Q8TAW3 534 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 PGAM5Q96HS1 289 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 BRD7Q9NPI1 651 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 RAB21Q9UL25 225 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 LCE6AA0A183 80 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 DHRS12A0PJE2 317 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 C17orf98A8MV24 154 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 RAMP3O60896 148 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ATP6V1G1O75348 118 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 DIRAS1O95057 198 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 LPLP06858 475 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 PRDX2P32119 198 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 GPM6AP51674 278 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 LIPEQ05469 1076 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 TEX30Q5JUR7 227 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF626Q68DY1 528 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 PRSS45Q7RTY3 260 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CPOQ8IVL8 374 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CD177Q8N6Q3 437 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF565Q8N9K5 539 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF511Q8NB15 262 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 Q8NFD4 153 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 NDNFQ8TB73 568 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 BCAS4Q8TDM0 211 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZNRF4Q8WWF5 429 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 HPSE2Q8WWQ2 592 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 FAM162AQ96A26 154 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 RGCCQ9H4X1 137 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 PALMDQ9NP74 551 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CMTM6Q9NX76 183 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 RASL12Q9NYN1 266 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 NDUFAF4Q9P032 175 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CD300AQ9UGN4 299 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF732B4DXR9 585 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 CIDEAO60543 219 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 PIPP12273 146 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 LYL1P12980 280 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ACKR3P25106 362 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 IFNGR2P38484 337 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 MYCNOSP40205 109 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 THBS3P49746 956 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SMIM11AP58511 58 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 GNG3P63215 75 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 KLF10Q13118 480 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 LCN8Q6JVE9 175 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-210ENST00000578916 ARPINQ7Z6K5 226 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 178 ms