RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575909.1

TOM1L1-222, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-222	ENST00000575909	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ORC5	O43913	435 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PDE6D	O43924	150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC19A2	O60779	497 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SC5D	O75845	299 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RCBTB2	O95199	551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	HTR1A	P08908	422 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CST2	P09228	141 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	DDOST	P39656	456 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PMEL	P40967	661 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CDKN2D	P55273	166 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	QPRT	Q15274	297 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR8G1	Q15617	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	NSDHL	Q15738	373 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM78B	Q5VT40	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM205	Q6UW68	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR8U1	Q8NH10	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ASB13	Q8WXK3	278 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	NIPAL2	Q9H841	368 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CLN6	Q9NWW5	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	GOLGA3	Q08378	1498 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A0G2JMP0	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909		H7C417	338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	AIRE	O43918	545 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC16A7	O60669	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	HLA-H	P01893	362 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TYMS	P04818	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PAEP	P09466	180 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ADORA1	P30542	326 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	FMO3	P31513	532 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	FOXN2	P32314	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CD200	P41217	278 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	MAP2K4	P45985	399 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	DSCR10	P59022	87 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RAB5B	P61020	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	NCALD	P61601	193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SELENOT	P62341	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TBPL1	P62380	186 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ACVR1	Q04771	509 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	BTN1A1	Q13410	526 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	VGLL4	Q14135	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PRSS8	Q16651	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CROCCP2	Q86T23	111 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR6V1	Q8N148	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	NEIL2	Q969S2	332 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	NUS1	Q96E22	293 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	KCNA7	Q96RP8	456 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	RBKS	Q9H477	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	CALML5	Q9NZT1	146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	AP4S1	Q9Y587	144 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A1B0GW55	424 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A1W2PPE3	182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	IGSF23	A1L1A6	192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-222	ENST00000575909	GPR31	O00270	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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