RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572205.5

SMG6-210, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 4

Gene SMG6, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-210ENST00000572205 SYT7O43581 403 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 ZNF737O75373 536 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 IGKV1D-12P01611 117 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 PIPP12273 146 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 IRF2P14316 349 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 CAPGP40121 348 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 NPY4RP50391 375 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 AQP4P55087 323 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 DLX1P56177 255 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 FGF12P61328 243 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 ACTA2P62736 377 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 ACTG2P63267 376 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 MZT1Q08AG7 82 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 IL24Q13007 206 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 IL18R1Q13478 541 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 CDK5R1Q15078 307 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 OR2G6Q5TZ20 316 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 HCP5Q6MZN7 132 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 USP43Q70EL4 1123 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 MOB3CQ70IA8 216 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 UTS2BQ765I0 119 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 SGCDQ92629 289 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 TNFRSF14Q92956 283 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 C10orf35Q96D05 121 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 TECTBQ96PL2 329 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 PKIBQ9C010 78 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 ERVK-18Q9QC07 812 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 NLKQ9UBE8 527 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.15□□□□□ -1.26
SMG6-210ENST00000572205 A0A1B0GVI7 797 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 OR2AT4A6NND4 320 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 ZNF879B4DU55 563 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 J3QLW9 94 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 NDUFA2O43678 99 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 XPNPEP2O43895 674 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 MT-ND2P03891 347 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 ZNF19P17023 458 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 HAAOP46952 286 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 ZP1P60852 638 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 MICBQ29980 383 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 BTN2A1Q7KYR7 527 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 COMMD2Q86X83 199 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 BATF2Q8N1L9 274 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 NPRL2Q8WTW4 380 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 CYGBQ8WWM9 190 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 GGHQ92820 318 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 AJUBAQ96IF1 538 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 DCLRE1BQ9H816 532 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 AUP1Q9Y679 476 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.14□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 MAGEA13PA6NCF6 341 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 OGG1O15527 345 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 TCF21O43680 179 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 FADS2O95864 444 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 HTR1AP08908 422 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 GLRA1P23415 457 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 NPBWR2P48146 333 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 DLX6P56179 175 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 CAV3P56539 151 aa7.13□□□□□ -1.27
SMG6-210ENST00000572205 GMFBP60983 142 aa7.13□□□□□ -1.27
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