RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa17.58■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 UTS2BQ765I0 119 aa17.58■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 DNAAF1Q8NEP3 725 aa17.58■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM185AQ8NFB2 350 aa17.58■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 GATAD2BQ8WXI9 593 aa17.58■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 LHX4Q969G2 390 aa17.58■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 FGGYQ96C11 551 aa17.58■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 BORCS8Q96FH0 119 aa17.58■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 DUX5Q96PT3 197 aa17.58■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 HHLA2Q9UM44 414 aa17.58■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa17.57■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa17.57■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 CLIC3O95833 236 aa17.57■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 IGHV1-69P01742 117 aa17.57■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 PEX2P28328 305 aa17.57■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 COMPP49747 757 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 TTC23Q5W5X9 447 aa17.57■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 C12orf54Q6X4T0 127 aa17.57■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 VMO1Q7Z5L0 202 aa17.57■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 CMTM4Q8IZR5 234 aa17.57■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 OR10AC1Q8NH08 325 aa17.57■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 JAM3Q9BX67 310 aa17.57■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 MTCH1Q9NZJ7 389 aa17.57■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa17.56■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 ANKRD65E5RJM6 399 aa17.56■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 KNG1P01042 644 aa17.56■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF20P17024 532 aa17.56■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 ATF1P18846 271 aa17.56■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 SLC9A3R2Q15599 337 aa17.56■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa17.56■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 BATF2Q8N1L9 274 aa17.56■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF561Q8N587 486 aa17.56■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 Q8N7P7 452 aa17.56■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF676Q8N7Q3 588 aa17.56■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 OR51A4Q8NGJ6 313 aa17.56■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 CYGBQ8WWM9 190 aa17.56■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa17.55■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 E9PI62 339 aa17.55■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 SLC1A7O00341 560 aa17.55■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 LIMS3P0CW19 117 aa17.55■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 LIMS4P0CW20 117 aa17.55■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 PRKACBP22694 351 aa17.55■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 RBP2P50120 134 aa17.55■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 ATP1B3P54709 279 aa17.55■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 DHRSXQ8N5I4 330 aa17.55■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 CNIH3Q8TBE1 160 aa17.55■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 ZDHHC16Q969W1 377 aa17.55■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 SLC25A28Q96A46 364 aa17.55■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 CEP19Q96LK0 163 aa17.55■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 NOX4Q9NPH5 578 aa17.55■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 A0A1W2PQ09 198 aa17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 F8VVB4 439 aa17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 F8VWA3 439 aa17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 M0R1W7 72 aa17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 ZFPL1O95159 310 aa17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 RPSAP08865 295 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 DCKP27707 260 aa17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 CAPZA1P52907 286 aa17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 Q6YL49 198 aa17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 SLC25A26Q70HW3 274 aa17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 OR13C3Q8NGS6 347 aa17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 SLAMF9Q96A28 289 aa17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 SPSB1Q96BD6 273 aa17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 SIRT7Q9NRC8 400 aa17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 OR14J1Q9UGF5 321 aa17.54■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM212A6NML5 194 aa17.53■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC159P0C7I6 412 aa17.53■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 MTCP1P56278 107 aa17.53■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 PDZD9Q8IXQ8 264 aa17.53■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 SETD9Q8NE22 299 aa17.53■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 TNFRSF14Q92956 283 aa17.53■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 IRGMA1A4Y4 181 aa17.52■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa17.52■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 MT-ND2P03891 347 aa17.52■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 HKR1P10072 659 aa17.52■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 IL18R1Q13478 541 aa17.52■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 BLMHQ13867 455 aa17.52■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa17.52■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 MKXQ8IYA7 352 aa17.52■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 PIP4P2Q8N4L2 257 aa17.52■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 OR5AK2Q8NH90 309 aa17.52■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 COMMD4Q9H0A8 199 aa17.52■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 FAM234AQ9H0X4 552 aa17.52■□□□□ 0.4
RNPS1-218ENST00000566180 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms