RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557439.5

XRCC3-218, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

TSL 5

Gene XRCC3, Length 2,599 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-218ENST00000557439 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
XRCC3-218ENST00000557439 NFYBP25208 207 aa15.4■□□□□ 0.06
XRCC3-218ENST00000557439 HTR5AP47898 357 aa15.4■□□□□ 0.06
XRCC3-218ENST00000557439 B3GALT5-AS1P59052 145 aa15.4■□□□□ 0.06
XRCC3-218ENST00000557439 NAAAQ02083 359 aa15.4■□□□□ 0.06
XRCC3-218ENST00000557439 SCRN3Q0VDG4 424 aa15.4■□□□□ 0.06
XRCC3-218ENST00000557439 IL11RAQ14626 422 aa15.4■□□□□ 0.06
XRCC3-218ENST00000557439 GGNBP1Q5YKI7 109 aa15.4■□□□□ 0.06
XRCC3-218ENST00000557439 LPAR3Q9UBY5 353 aa15.4■□□□□ 0.06
XRCC3-218ENST00000557439 PADI1Q9ULC6 663 aa15.4■□□□□ 0.06
XRCC3-218ENST00000557439 DOCK7Q96N67 2140 aa15.4■□□□□ 0.06
XRCC3-218ENST00000557439 MED6O75586 246 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 VAMP5O95183 116 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 NR2C1P13056 603 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 RFC3P40938 356 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 PIGPP57054 158 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 MLF1P58340 268 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 Q0VFX4 171 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 C9orf135Q5VTT2 229 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 UQCC3Q6UW78 93 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 TAF9BQ9HBM6 251 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 FAM186AA6NE01 2351 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 XRCC2O43543 280 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 DIRAS3O95661 229 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 FAM189A2Q15884 450 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 EXT1Q16394 746 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 OR2Y1Q8NGV0 311 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 OR11L1Q8NGX0 322 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 OR1F12Q8NHA8 337 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 AIFM2Q9BRQ8 373 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 METTL9Q9H1A3 318 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 FBXL17Q9UF56 701 aa15.39■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF587BE7ETH6 402 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 CBR3O75828 277 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 CARD18P57730 90 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 PSG4Q00888 419 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF92Q03936 586 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 LPAL2Q16609 132 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 CEACAM16Q2WEN9 425 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 Q6ZPA2 131 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 GGNQ86UU5 652 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 SGPP2Q8IWX5 399 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 FBXL14Q8N1E6 418 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 FNDC9Q8TBE3 224 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 ABHD3Q8WU67 409 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 ERGIC1Q969X5 290 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 C1orf123Q9NWV4 160 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 C9JQL5 133 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 OR5AC1P0C628 307 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 RPL12P30050 165 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 CLDN15P56746 228 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 AKIRIN2Q53H80 203 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 SVBPQ8N300 66 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 OR10AD1Q8NGE0 317 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 BORCS8Q96FH0 119 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 RHOFQ9HBH0 211 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 DEPPQ9NTK1 212 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 UQCC1Q9NVA1 299 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 TMEM38BQ9NVV0 291 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 DOCK10Q96BY6 2186 aa15.38■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 PINLYPA6NC86 204 aa15.37■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 FCGR3AP08637 254 aa15.37■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 FCGR2CP31995 323 aa15.37■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 RAB35Q15286 201 aa15.37■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 AAED1Q7RTV5 226 aa15.37■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 LYZL2Q7Z4W2 148 aa15.37■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 OR5L1Q8NGL2 311 aa15.37■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 M1APQ8TC57 530 aa15.37■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 MMP26Q9NRE1 261 aa15.37■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa15.37■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF716A6NP11 495 aa15.37■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 PJVKQ0ZLH3 352 aa15.37■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 STK11Q15831 433 aa15.37■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 SLC22A25Q6T423 547 aa15.37■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 PIGCQ92535 297 aa15.37■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 C3orf80F5H4A9 247 aa15.36■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 K7EPK0 472 aa15.36■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 NRASP01111 189 aa15.36■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 FOLR3P41439 243 aa15.36■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 TMEM33P57088 247 aa15.36■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 RAC3P60763 192 aa15.36■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 ETV3LQ6ZN32 361 aa15.36■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa15.36■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 OR10D3Q8NH80 312 aa15.36■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 GPHA2Q96T91 129 aa15.36■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 P4HTMQ9NXG6 502 aa15.36■□□□□ 0.05
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF407Q9C0G0 2248 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms