RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 NEU3Q9UQ49 428 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 STARD10Q9Y365 291 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 NPTNQ9Y639 398 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 M0R1X1 148 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 CRHP06850 196 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 PTHLHP12272 177 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 EDN3P14138 238 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 CPN1P15169 458 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 TESK1Q15569 626 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 SSX2Q16385 188 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 SUMF1Q8NBK3 374 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 OSGIN2Q9Y236 505 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 SP1P08047 785 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 P2RY1P47900 373 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 RHOBP62745 196 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF225Q9UK10 706 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 PRNDQ9UKY0 176 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 TXNL1O43396 289 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 OR2H1Q9GZK4 316 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 GPR35Q9HC97 309 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PPV9 198 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 HMSDA8MTL9 139 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF727A8MUV8 499 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 NDUFA2O43678 99 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 CTAG2O75638 210 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 OR2C1O95371 312 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 TXNDC12O95881 172 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 COX5BP10606 129 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF83P51522 516 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 ADGRG7Q96K78 797 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 SBF2Q86WG5 1849 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 NRXN2Q9P2S2 1712 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 TAF1LQ8IZX4 1826 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 OIP5O43482 229 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 CEACAM6P40199 344 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 CRYBB2P43320 205 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 OR4A4PQ8NGN8 299 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 ANGPTL4Q9BY76 406 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 GHITMQ9H3K2 345 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM38BQ9NVV0 291 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 NTMQ9P121 344 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 MOSPD3O75425 235 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 C1QAP02745 245 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF774Q6NX45 483 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 PECRQ9BY49 303 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 MMP26Q9NRE1 261 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 MMP9P14780 707 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 CDAP32320 146 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 DCAF10Q5QP82 559 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 NCR3LG1Q68D85 454 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2FQ969M7 185 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 PIPOXQ9P0Z9 390 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 EPHA2P29317 976 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 TOR2AQ5JU69 321 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 FBXW9Q5XUX1 488 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 WDR73Q6P4I2 378 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 GCSAMQ8N6F7 178 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 RASL12Q9NYN1 266 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 OR2M5A3KFT3 312 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 GPANK1O95872 356 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 KRASP01116 189 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 LPAR6P43657 344 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 PET117Q6UWS5 81 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 DEFB108BQ8NET1 73 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF721Q8TF20 911 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 RNF133Q8WVZ7 376 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0U1RQV5 110 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 DHRS7CA6NNS2 312 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms