RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 GCM1Q9NP62 436 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 IL19Q9UHD0 177 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 ING4Q9UNL4 249 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 A0A075B6Q4 140 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 A0A0A6YYD4 124 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 H7C417 338 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 AKR7A2O43488 359 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 CDC14BO60729 498 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 HPGDSO60760 199 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 KDM4BO94953 1096 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 BPNT1O95861 308 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 TFF1P04155 84 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 PGA5P0DJD9 388 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 BMP4P12644 408 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 ARSBP15848 533 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 SERPINA2P20848 420 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 SOX6P35712 828 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 PSMD7P51665 324 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 BMXP51813 675 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 ERVK11-1P61568 191 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 MADCAM1Q13477 382 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 TESK1Q15569 626 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 DGUOKQ16854 277 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 ZNF404Q494X3 552 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 GCSAMQ8N6F7 178 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 DTX3Q8N9I9 347 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 POC1AQ8NBT0 407 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 PXT1Q8NFP0 134 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 Q8TCH9 128 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 LRRC29Q8WV35 223 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 DIRC2Q96SL1 478 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 GAL3ST1Q99999 423 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 SPATA2Q9UM82 520 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 MTORP42345 2549 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 RP2O75695 350 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 CLPXO76031 633 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 ZNF205O95201 554 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 HTR3BO95264 441 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 MPIG6BO95866 241 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 LHBP01229 141 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 TNFSF4P23510 183 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 COL8A2P25067 703 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 SSTR2P30874 369 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 CD80P33681 288 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 PDCD1Q15116 288 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 RSU1Q15404 277 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 PIGYQ3MUY2 71 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 Q8NFD4 153 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 CEP19Q96LK0 163 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 CCL19Q99731 98 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 NICN1Q9BSH3 213 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 METTL9Q9H1A3 318 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 HES4Q9HCC6 221 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 DECR2Q9NUI1 292 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 IL36GQ9NZH8 169 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 HIVEP1P15822 2718 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 DYSFO75923 2080 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 AKAP9Q99996 3911 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 SRRM5B3KS81 715 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms