RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 GATA4P43694 442 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 RAB25P57735 213 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 TAS2R43P59537 309 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 GRK1Q15835 563 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF79Q15937 498 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 WDR86Q86TI4 376 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 OR8H3Q8N146 312 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 HPSE2Q8WWQ2 592 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 OR5P3Q8WZ94 311 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 PIGCQ92535 297 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 WDFY2Q96P53 400 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 SAP30LQ9HAJ7 183 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 SMURF1Q9HCE7 757 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 DECR2Q9NUI1 292 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 TANC2Q9HCD6 1990 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 A6NIN4 97 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 TNFSF4P23510 183 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 RBMXP38159 391 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 BAK1Q16611 211 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 FTMTQ8N4E7 242 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 WFDC11Q8NEX6 87 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 C10orf105Q8TEF2 133 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 GHSRQ92847 366 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 C10orf35Q96D05 121 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 EGLN1Q9GZT9 426 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 ISYNA1Q9NPH2 558 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 GLS2Q9UI32 602 aa10.75□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 OTOGQ6ZRI0 2925 aa10.74□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 TEX15Q9BXT5 2789 aa10.74□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa10.74□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 VWC2LB2RUY7 222 aa10.74□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 CDC14BO60729 498 aa10.74□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 GIFP27352 417 aa10.74□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 SRP9P49458 86 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC3A1Q07837 685 aa10.74□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 ZMYND11Q15326 602 aa10.74□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 CLEC12BQ2HXU8 276 aa10.74□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 FAM76BQ5HYJ3 339 aa10.74□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 C11orf53Q8IXP5 236 aa10.74□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa10.74□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 COMMD4Q9H0A8 199 aa10.74□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 GCM1Q9NP62 436 aa10.74□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF281Q9Y2X9 895 aa10.74□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 CCDC168Q8NDH2 2452 aa10.74□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 A0A0B4J203 849 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 NRASP01111 189 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 TNFRSF1AP19438 455 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 CELP19835 753 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 THBS2P35442 1172 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 GNALP38405 381 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 PDLIM4P50479 330 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 DSCR9P59020 149 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 BTN1A1Q13410 526 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 TPBGQ13641 420 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 MED22Q15528 200 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 MPPED2Q15777 294 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 UBE2V2Q15819 145 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 TATDN3Q17R31 274 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 CEACAM21Q3KPI0 293 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 MOB3CQ70IA8 216 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 OR13C5Q8NGS8 318 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 FGGYQ96C11 551 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 SHARPINQ9H0F6 387 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 ABCB9Q9NP78 766 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 DLL4Q9NR61 685 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 DCAF16Q9NXF7 216 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 CSF3P09919 207 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 DMRTC1Q5HYR2 192 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 ASPHD2Q6ICH7 369 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 SPNS3Q6ZMD2 512 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF367Q7RTV3 350 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 OR13C3Q8NGS6 347 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 Q96MF0 132 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 CHST5Q9GZS9 411 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 TLNRD1Q9H1K6 362 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 CHODLQ9H9P2 273 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 GPR173Q9NS66 373 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 TREM2Q9NZC2 230 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 ALG5Q9Y673 324 aa10.73□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 MYO9AB2RTY4 2548 aa10.72□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 DYSFO75923 2080 aa10.72□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 A0A096LNT2 108 aa10.72□□□□□ -0.69
RPUSD4-208ENST00000533628 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms