RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CDH24Q86UP0 819 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 C11orf53Q8IXP5 236 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 BPIFB2Q8N4F0 458 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 Q8NFD4 153 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM57AQ8TBR7 257 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SLX1AQ9BQ83 275 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 OCSTAMPQ9BR26 566 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RGCCQ9H4X1 137 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 DLL4Q9NR61 685 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 GLRX2Q9NS18 164 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ASF1BQ9NVP2 202 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 KCNN3Q9UGI6 736 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC25A15Q9Y619 301 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 MEIKINA0A087WXM9 373 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF732B4DXR9 585 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 MPZP25189 248 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 HAAOP46952 286 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 FUT6P51993 359 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RAG2P55895 527 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RBM11P57052 281 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 BAMBIQ13145 260 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 NKAPLQ5M9Q1 402 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 NOXA1Q86UR1 476 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 LHFPL1Q86WI0 220 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM219AQ8IW50 185 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 C9orf62Q8N4C0 152 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 S100PBPQ96BU1 408 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 BORCS8Q96FH0 119 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CST11Q9H112 138 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC2A8Q9NY64 477 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 IL36GQ9NZH8 169 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ATRXP46100 2492 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 HCFC1P51610 2035 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CSMD1Q96PZ7 3565 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 TANC2Q9HCD6 1990 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 METTL21EPA6NDL7 271 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 OR5H14A6NHG9 310 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CENPXA8MT69 81 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 GSTT2BP0CG30 244 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 UBBP0CG47 229 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 PI3P19957 117 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 OPRM1P35372 400 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 APLNRP35414 380 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 PPP1CBP62140 327 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM27E3Q08E93 113 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CD276Q5ZPR3 534 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 FBXW12Q6X9E4 464 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 HOGA1Q86XE5 327 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 OR56B1Q8NGI3 324 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 OR51F2Q8NH61 342 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 MARCH1Q8TCQ1 289 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 OR51I2Q9H344 312 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 C5orf66Q9H5L9 145 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF391Q9UJN7 358 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 OSGIN2Q9Y236 505 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF835Q9Y2P0 537 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CADP27708 2225 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 UBE2QL1A1L167 161 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 C1QBP02746 253 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CHRM2P08172 466 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RPS2P15880 293 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CBR1P16152 277 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 GZMKP49863 264 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 UCP2P55851 309 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 MAB21L1Q13394 359 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RSU1Q15404 277 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ZFP69Q49AA0 526 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RAB12Q6IQ22 244 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 LIN54Q6MZP7 749 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 PCSK4Q6UW60 755 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 OSR2Q8N2R0 312 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CCDC54Q8NEL0 328 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 PXT1Q8NFP0 134 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 METTL9Q9H1A3 318 aa4.11□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 COPZ2Q9P299 210 aa4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms