RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476784.5

TTC3-215, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTC3, Length 7,425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-215ENST00000476784 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 LURAP1LQ8IV03 231 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 OR1N2Q8NGR9 330 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 LHX4Q969G2 390 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SDF2Q99470 211 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PHOX2AO14813 284 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CDK2AP2O75956 126 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SRMP19623 302 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 USF1P22415 310 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 IGFBP7Q16270 282 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 AFMIDQ63HM1 303 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 LHFPL5Q8TAF8 219 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 DERL3Q96Q80 235 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 LOC105371242A0A075B767 164 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 H7C2G1 150 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 GPRIN2O60269 458 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 MMP11P24347 488 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 KIR2DS2P43631 304 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 GALR1P47211 349 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 NUBP1P53384 320 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CGB2Q6NT52 195 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ATG2BQ96BY7 2078 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 OR2A5Q96R48 311 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PRDM7Q9NQW5 492 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.96□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PRR32B1ATL7 298 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 LRP3O75074 770 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SRD5A2P31213 254 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PDZD11Q5EBL8 140 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PMS2CLQ68D20 193 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ZNF547Q8IVP9 402 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 OR2L13Q8N349 312 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 OR4P4Q8NGL7 312 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 OR2Y1Q8NGV0 311 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 C7orf72A4D263 438 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 LALBAP00709 142 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CSN3P07498 182 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 LPAR6P43657 344 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PIGPP57054 158 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PRSS48Q7RTY5 328 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 MRGPREQ86SM8 312 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PPP6CO00743 305 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PAPLNO95428 1278 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 TEAD1P28347 426 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CALCRP30988 508 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 RPL31P62899 125 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ZNF596Q8TC21 504 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 H0YIV9 168 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PRAF2O60831 178 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SLC35D3Q5M8T2 416 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SLC16A13Q7RTY0 426 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 HARBI1Q96MB7 349 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 TAF9BQ9HBM6 251 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 FOXH1O75593 365 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ATF1P18846 271 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 IQCJQ1A5X6 159 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 LHX8Q68G74 356 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PDPNQ86YL7 162 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 LACC1Q8IV20 430 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 COMMD1Q8N668 190 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 OR52N4Q8NGI2 321 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ARHGDIGQ99819 225 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 KLK11Q9UBX7 282 aa5.95□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 MPZL1O95297 269 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 UBA52P62987 128 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ATP5G2Q06055 141 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SLC25A53Q5H9E4 307 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 DEDD2Q8WXF8 326 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ZNF416Q9BWM5 594 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CACFD1Q9UGQ2 172 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 EREGO14944 169 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 NKG7Q16617 165 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ZNF787Q6DD87 383 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 TRAT1Q6PIZ9 186 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 NKAIN4Q8IVV8 208 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 LSMEM1Q8N8F7 131 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 GDPD1Q8N9F7 314 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms