RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 ATF1P18846 271 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 GABRA2P47869 451 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 TAS2R43P59537 309 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 FGF12P61328 243 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 PARP16Q8N5Y8 322 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 FAM216BQ8N7L0 139 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 LY6G5BQ8NDX9 201 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 OR5T2Q8NGG2 359 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 OR52N1Q8NH53 320 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 TFAP2CQ92754 450 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 FGGYQ96C11 551 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 CEP19Q96LK0 163 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 OPALINQ96PE5 141 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 DCTN5Q9BTE1 182 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 FAM234AQ9H0X4 552 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 SNTG1Q9NSN8 517 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 BABAM2Q9NXR7 383 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 SYNGR1O43759 233 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 MTCP1P56278 107 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 GMFBP60983 142 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ERVK11-1P61568 191 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ST3GAL4Q11206 333 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 IKZF1Q13422 519 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 BLMHQ13867 455 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 TUSC1Q2TAM9 212 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 CALHM1Q8IU99 346 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 GPR148Q8TDV2 347 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 NPRL2Q8WTW4 380 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 FBLIM1Q8WUP2 373 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 SEH1LQ96EE3 360 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 GAFA1Q96PS6 74 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 C19orf24Q9BVV8 132 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 RASSF4Q9H2L5 321 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 GLS2Q9UI32 602 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ZNF222Q9UK12 451 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 DHDHQ9UQ10 334 aa11.04□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 TRAV40A0A0B4J280 105 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 A0A1W2PPE2 198 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 A0A1W2PR64 198 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 A0A1W2PRV1 198 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 RFPL4AA6NLU0 287 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 M0R1W7 72 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 MAGEB3O15480 346 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 CHRM2P08172 466 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 NDUFB7P17568 137 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 AMY2BP19961 511 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 PRDX2P32119 198 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 HSPA13P48723 471 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ETV1P50549 477 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 GUCA2AQ02747 115 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 DMRTC1Q5HYR2 192 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 SPIN3Q5JUX0 258 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ANGPTL5Q86XS5 388 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 SAXO1Q8IYX7 474 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 STX19Q8N4C7 294 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 TMEM185AQ8NFB2 350 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 OR5D13Q8NGL4 314 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 FAM216AQ8WUB2 273 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 GATAD2BQ8WXI9 593 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 THRSPQ92748 146 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 SLC6A7Q99884 636 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 PCGF1Q9BSM1 259 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa11.03□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ANK2Q01484 3957 aa11.02□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ERICH4A6NGS2 130 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 H3BSH0 61 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 OGG1O15527 345 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 SULT1B1O43704 296 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 MMP9P14780 707 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 BMXP51813 675 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 CAPZA1P52907 286 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 CDK5R1Q15078 307 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 DGUOKQ16854 277 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 NCR3LG1Q68D85 454 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 SLC25A26Q70HW3 274 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 ZNRF1Q8ND25 227 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 RPS4Y2Q8TD47 263 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 GGHQ92820 318 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 SMIM19Q96E16 107 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 SIRPDQ9H106 197 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 NOX4Q9NPH5 578 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 SCN3BQ9NY72 215 aa11.02□□□□□ -0.65
PRAME-211ENST00000476336 MTCH1Q9NZJ7 389 aa11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms