RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471364.1

RUBCN-208, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, human

TSL 3

Gene RUBCN, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUBCN-208	ENST00000471364	SHISA9	B4DS77	424 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	MT-ND4	P03905	459 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CCL2	P13500	99 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CCNO	P22674	350 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC6A1	P30531	599 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	RANBP1	P43487	201 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	GUCA2A	Q02747	115 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	PLP2	Q04941	152 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	OR8B8	Q15620	311 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	GSG1	Q2KHT4	349 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	PLET1	Q6UQ28	207 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	MDP1	Q86V88	176 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	RADIL	Q96JH8	1075 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF75A	Q96N20	296 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A096LNT2	108 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A0B4J293	547 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	HAX1	O00165	279 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ABCD4	O14678	606 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	GMDS	O60547	372 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	LYZL6	O75951	148 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	UBB	P0CG47	229 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC25A16	P16260	332 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	PRSS3	P35030	304 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CD300C	Q08708	224 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	KISS1	Q15726	138 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	GABRA6	Q16445	453 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM42	Q69YG0	159 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ITFG2	Q969R8	447 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	UPRT	Q96BW1	309 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	KLK11	Q9UBX7	282 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	PLCE1	Q9P212	2302 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364		H7C417	338 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	RAB27B	O00194	218 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CDC14B	O60729	498 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	RAD51D	O75771	328 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	RBBP9	O75884	186 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	MPIG6B	O95866	241 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	GSTT2B	P0CG30	244 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	NAT2	P11245	290 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	COX5A	P20674	150 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	APLNR	P35414	380 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ALDH3B1	P43353	468 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	AP3S2	P59780	193 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	MOB3C	Q70IA8	216 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	GPX8	Q8TED1	209 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	SPSB1	Q96BD6	273 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	RNF170	Q96K19	258 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	POFUT1	Q9H488	388 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ING4	Q9UNL4	249 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	STARD10	Q9Y365	291 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A0A6YYD4	124 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A1W2PP11	408 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A1W2PR80	420 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	SULT1C2	O00338	296 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	SCGN	O76038	276 aa		10.8	□□□□□ -0.68

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