RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471202.5

CHTF18-208, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, human

TSL 2

Gene CHTF18, Length 4,494 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHTF18-208	ENST00000471202	OTOF	Q9HC10	1997 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	PPP5D1	E7EU14	171 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	OR5AC1	P0C628	307 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	SFTA3	P0C7M3	94 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	RBPJ	Q06330	500 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	GUK1	Q16774	197 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	TRIM64B	A6NI03	449 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	SEMA7A	O75326	666 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	CD1A	P06126	327 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	GAB4	Q2WGN9	574 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	PECR	Q9BY49	303 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	FBXL17	Q9UF56	701 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	IGF2	P01344	180 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	IL2RA	P01589	272 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	PRDX4	Q13162	271 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	DHRS13	Q6UX07	377 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	UCN2	Q96RP3	112 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	MMP26	Q9NRE1	261 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	CACNA1G	O43497	2377 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	NAA60	Q9H7X0	242 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	CLEC1B	Q9P126	229 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	KRAS	P01116	189 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	CCL3	P10147	92 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	PNLIP	P16233	465 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	IFITM2	Q01629	132 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	MGAT2	Q10469	447 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	SHISA3	A0PJX4	238 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	BTBD17	A6NE02	478 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	SCGB1D1	O95968	90 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	GSK3A	P49840	483 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	MICB	Q29980	383 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	FHL5	Q5TD97	284 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	BORCS7	Q96B45	105 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	AP1S3	Q96PC3	154 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	OPA3	Q9H6K4	179 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	RASL12	Q9NYN1	266 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	PIN1P1	O15428	100 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	CA6	P23280	308 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	PMP22	Q01453	160 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	OR4F5	Q8NH21	305 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	SLC39A7	Q92504	469 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	GALM	Q96C23	342 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	BTF3L4	Q96K17	158 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	OR4F4	Q96R69	305 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	DECR2	Q9NUI1	292 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	PROCR	Q9UNN8	238 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202		A0A1W2PR80	420 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	B3GALNT1	O75752	331 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	ZNF205	O95201	554 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	TTR	P02766	147 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	EDEM2	Q9BV94	578 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202		A0A1W2PPC1	479 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	LINC00862	A6NCI5	91 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	THY1	P04216	161 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	ARL3	P36405	182 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	MPL	P40238	635 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	TMEM33	P57088	247 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	ERGIC1	Q969X5	290 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHTF18-208	ENST00000471202	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms