RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457356.8

MSC-AS1-201, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MSC-AS1, Length 4,220 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-201ENST00000457356 OR8B4Q96RC9 309 aa8.71□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.71□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 A0A1W2PPE2 198 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 H3BMH7 237 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 DEGS1O15121 323 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 PMCHP20382 165 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 TMEM33P57088 247 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
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MSC-AS1-201ENST00000457356 HFEQ30201 348 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 OR4D11Q8NGI4 311 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 GPX8Q8TED1 209 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 VAMP8Q9BV40 100 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 SLC31A2O15432 143 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 NMBP08949 121 aa8.7□□□□□ -1.02
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MSC-AS1-201ENST00000457356 RFC3P40938 356 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 PTGFRP43088 359 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 GRB2P62993 217 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 IQCJQ1A5X6 159 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 EMC4Q5J8M3 183 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 ELFN2Q5R3F8 820 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 NRTNQ99748 197 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 TXNIPQ9H3M7 391 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 CA10Q9NS85 328 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 LANCL2Q9NS86 450 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 GHRLQ9UBU3 117 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 WNT11O96014 354 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 CST2P09228 141 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 PCP4P48539 62 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 GUCA2BQ16661 112 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 PRR27Q6MZM9 219 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 TMEM91Q6ZNR0 172 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 OTOSQ8NHW6 89 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 SNX22Q96L94 193 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 C4orf45Q96LM5 186 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 PSENENQ9NZ42 101 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 MMACHCQ9Y4U1 282 aa8.7□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 XKRY2A2RUG3 117 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 OR7C2O60412 319 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 ICOSLGO75144 302 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 BMP5P22003 454 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 PAX6P26367 422 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 CDAP32320 146 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 PTTG1IPP53801 180 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZNF596Q8TC21 504 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 PRDM7Q9NQW5 492 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 LRP12Q9Y561 859 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 CDRT15L2A8MXV6 281 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 THBS3P49746 956 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 HIST1H3AP68431 136 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 MOGAT2Q3SYC2 334 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZNF485Q8NCK3 441 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 CMTM3Q96MX0 182 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 GPR137Q96N19 417 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 A0A1W2PR80 420 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 CLEC18AA5D8T8 446 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 YIF1AO95070 293 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 NRASP01111 189 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 CEACAM1P13688 526 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 GALP22466 123 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 UCNP55089 124 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 FBXL14Q8N1E6 418 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZNF383Q8NA42 475 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 CLEC18CQ8NCF0 446 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 MVB12AQ96EY5 273 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.69□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 IL17BQ9UHF5 180 aa8.69□□□□□ -1.02
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