RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 PPIHO43447 177 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 SEMA7AO75326 666 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 ZNF737O75373 536 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 Q6ZN92 141 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 C5orf17Q8NAS9 161 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 MRGPRX3Q96LB0 322 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 SSC5DA1L4H1 1573 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 IGSF23A1L1A6 192 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 CYR61O00622 381 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 FGF17O60258 216 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 GPX5O75715 221 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 GCGP01275 180 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 PPOXP50336 477 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 CEACAM16Q2WEN9 425 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 CLLU1Q5K131 121 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 Q7L0L9 218 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 OR6S1Q8NH40 331 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 MYOZ3Q8TDC0 251 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 C10orf35Q96D05 121 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 PRRX2Q99811 253 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 TMEM202A6NGA9 273 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 HRO43593 1189 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 CST7O76096 145 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 SFTA3P0C7M3 94 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 PGA4P0DJD7 388 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 PGA5P0DJD9 388 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 PMS2P11Q13670 270 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 KCNAB1Q14722 419 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 AANATQ16613 207 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 SLC25A30Q5SVS4 291 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 FNDC7Q5VTL7 733 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 OR4C3Q8NH37 302 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 RPS4Y2Q8TD47 263 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 DOK1Q99704 481 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 PRSS1P07477 247 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 B4GALT1P15291 398 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 ST6GAL1P15907 406 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 PCMT1P22061 227 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 SPRED3Q2MJR0 410 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 MRGPRX1Q96LB2 322 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 SPACA5Q96QH8 159 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 FOXB1Q99853 325 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 ZNF407Q9C0G0 2248 aa5.99□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 SPRY3O43610 288 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 PTGFRP43088 359 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 CD81P60033 236 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 KISS1Q15726 138 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 FAHD1Q6P587 224 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 ETV3LQ6ZN32 361 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 RFLNAQ6ZTI6 216 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 LYG1Q8N1E2 194 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 SPEM1Q8N4L4 309 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 TEX29Q8N6K0 151 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 TMEM204Q9BSN7 226 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 FAM74A7A6NL05 159 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 ZBTB42B2RXF5 422 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 FAHP16930 419 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 C19orf57Q0VDD7 668 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 OR1C1Q15619 314 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 NAGKQ9UJ70 344 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 CES1P1Q9UKY3 287 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PPC4 97 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 FUCA1P04066 466 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 PPP2CAP67775 309 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 Q3ZCU0 254 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 C20orf196Q8IYI0 205 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 BATF2Q8N1L9 274 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 OR11G2Q8NGC1 345 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 TMEM37Q8WXS4 190 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 MARCH5Q9NX47 278 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 LRP12Q9Y561 859 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 HMSDA8MTL9 139 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 IGHA1P01876 353 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 IGHA2P01877 340 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 HLA-GP17693 338 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 BSGP35613 385 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 RAB9AP51151 201 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 LIAT1Q6ZQX7 453 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 MAVSQ7Z434 540 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 OR4D10Q8NGI6 311 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 FAHD2AQ96GK7 314 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 GABRG3Q99928 467 aa5.98□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 IL20Q9NYY1 176 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms