RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429663.5

AFG3L1P-209, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 3 BASIC

Gene AFG3L1P, Length 458 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-209	ENST00000429663	RORB	Q92753	470 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-209	ENST00000429663	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-209	ENST00000429663	USE1	Q9NZ43	259 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-209	ENST00000429663	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-209	ENST00000429663	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-209	ENST00000429663	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663		A0A1W2PPE2	198 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663		A0A1W2PR64	198 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663		A0A1W2PRV1	198 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	TK1	P04183	234 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	KRT8	P05787	483 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	ERVK11-1	P61568	191 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	IL24	Q13007	206 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	LY6E	Q16553	131 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	SSX6	Q7RTT6	188 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	CALHM1	Q8IU99	346 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	BATF2	Q8N1L9	274 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	PKIB	Q9C010	78 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	CCL3L1	P16619	93 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	FAS	P25445	335 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	PAX6	P26367	422 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	BMX	P51813	675 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	ERVFRD-1	P60508	538 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	ZNF273	Q14593	569 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	TBX5	Q99593	518 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	RAB18	Q9NP72	206 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663		K7N7A8	449 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	PLXNB1	O43157	2135 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	OR2T7	P0C7T2	308 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	COX7A1	P24310	79 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	HTR1F	P30939	366 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	KIR2DS4	P43632	304 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	EFNB2	P52799	333 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	LGALS4	P56470	323 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	BNIP1	Q12981	228 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	HERPUD1	Q15011	391 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	ODF4	Q2M2E3	257 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	C11orf88	Q6PI97	169 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	CIB1	Q99828	191 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	AP4S1	Q9Y587	144 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	METTL15	A6NJ78	407 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	C17orf98	A8MV24	154 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	SYT7	O43581	403 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	CSF1	P09603	554 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	DLX6	P56179	175 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	COL10A1	Q03692	680 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	UBE2V2	Q15819	145 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663		Q6ZTK2	550 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	PIFO	Q8TCI5	191 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663		H3BSH0	61 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	CHST1	O43916	411 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	ZNF737	O75373	536 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	SULT1C4	O75897	302 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	APOL3	O95236	402 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	CHRM2	P08172	466 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	FCGR1A	P12314	374 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	FUT6	P51993	359 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	CEP19	Q96LK0	163 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	CHST5	Q9GZS9	411 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	MEGF11	A6BM72	1044 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663	VGLL3	A8MV65	326 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-209	ENST00000429663		F8VVB4	439 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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