RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428343.5

RFX8-201, Transcript of RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RFX8, Length 1,686 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8-201ENST00000428343 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 OR10K1Q8NGX5 313 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 CEP19Q96LK0 163 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 GAL3ST1Q99999 423 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 PLGRKTQ9HBL7 147 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 OOEPA6NGQ2 149 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 SRRM5B3KS81 715 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 PDCD5O14737 125 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 LHBP01229 141 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 IGKV1D-12P01611 117 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 GYPAP02724 150 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 TFF1P04155 84 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 PGA5P0DJD9 388 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 MPZP25189 248 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 GIFP27352 417 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 SDC2P34741 201 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 NR4A2P43354 598 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 NCS1P62166 190 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 RSU1Q15404 277 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 MICBQ29980 383 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 AWAT2Q6E213 333 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 DNM1P46Q6ZS02 220 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 POC1AQ8NBT0 407 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 OR4D6Q8NGJ1 314 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 OR10Z1Q8NGY1 313 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 GFI1Q99684 422 aa11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 TEX15Q9BXT5 2789 aa11.64□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 SFTPBP07988 381 aa11.64□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 CLEC2LP0C7M8 214 aa11.64□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 RAB3BP20337 219 aa11.64□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 CFHR2P36980 270 aa11.64□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 CAV3P56539 151 aa11.64□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 SLC22A6Q4U2R8 563 aa11.64□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 HES5Q5TA89 166 aa11.64□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa11.64□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa11.64□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 NRIP2Q9BQI9 281 aa11.64□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 TMEM165Q9HC07 324 aa11.64□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 OR14J1Q9UGF5 321 aa11.64□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 PCDHB10Q9UN67 800 aa11.64□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 V9GY05 133 aa11.64□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 CCDC160A6NGH7 325 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 LGALS8O00214 317 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 HTR3BO95264 441 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 IGHV2-70P01814 119 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 PRKACAP17612 351 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 SERPINA2P20848 420 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 DUSP1P28562 367 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 MDH2P40926 338 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 GABRA2P47869 451 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 MTNR1BP49286 362 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 CLDN12P56749 244 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 P2RY14Q15391 338 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 ACP7Q6ZNF0 438 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 FAM90A1Q86YD7 464 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 TMEM246Q9BRR3 403 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 REG4Q9BYZ8 158 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 METTL9Q9H1A3 318 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 IL36RNQ9UBH0 155 aa11.63□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 VWC2LB2RUY7 222 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 CSTBP04080 98 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 SLC25A16P16260 332 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 HTR2CP28335 458 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 SMIM21Q3B7S5 101 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 LYPD2Q6UXB3 125 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 CCL13Q99616 98 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 UQCC2Q9BRT2 126 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 NLKQ9UBE8 527 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 A0A1W2PP11 408 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 RFPL4AA6NLU0 287 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 OR2AT4A6NND4 320 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 USF1P22415 310 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 SERPINB10P48595 397 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 PSMD7P51665 324 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 ERVK11-1P61568 191 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 SCN1BQ07699 218 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 PDCD1Q15116 288 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 RAB11BQ15907 218 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 ZNF404Q494X3 552 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 NR2C2APQ86WQ0 139 aa11.62□□□□□ -0.55
RFX8-201ENST00000428343 CDH26Q8IXH8 852 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms