RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427230.2

NANOGP4-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene NANOGP4, Length 913 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP4-201ENST00000427230 PRSS47A8MTI9 375 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 SNRPGP15A8MWD9 76 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 FAM25EA8MYX2 175 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 C5orf58C9J3I9 102 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 AIPO00170 330 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 PIN1P1O15428 100 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 PLPP2O43688 288 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 SELENOFO60613 162 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 PTP4A3O75365 173 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 RAD51DO75771 328 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 NUDT14O95848 222 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 SPARCP09486 303 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 IFI6P09912 130 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 SAGP10523 405 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 COX5AP20674 150 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 HTR1FP30939 366 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 IFNGR2P38484 337 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 OR3A2P47893 321 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 BLVRAP53004 296 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 BTN1A1Q13410 526 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 GGTLC2Q14390 218 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 CLVS2Q5SYC1 327 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 METTL11BQ5VVY1 283 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 OLFML2AQ68BL7 652 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC18B1Q6NT16 456 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 SLC27A4Q6P1M0 643 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 Q6ZT83 130 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 PRSS45Q7RTY3 260 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 PXKQ7Z7A4 578 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 NR2C2APQ86WQ0 139 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 FTMTQ8N4E7 242 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 TOMM5Q8N4H5 51 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 IQCF1Q8N6M8 205 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 COX18Q8N8Q8 333 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 BBS10Q8TAM1 723 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 TEX47Q8TBZ9 253 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 GPR119Q8TDV5 335 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 CDS1Q92903 461 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 DNAJA3Q96EY1 480 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 TMEM19Q96HH6 336 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 MS4A4EQ96PG1 132 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 ABHD1Q96SE0 405 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF607Q96SK3 696 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 NGBQ9NPG2 151 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 UBQLN4Q9NRR5 601 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 INPP5EQ9NRR6 644 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 PIPOXQ9P0Z9 390 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 ICAM5Q9UMF0 924 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 BAIAP2Q9UQB8 552 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 KCNE3Q9Y6H6 103 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP4-201ENST00000427230 TRAV6A0A075B6T7 132 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 A0A1B0GW55 424 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 PQLC2LA1A4F0 135 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 PGPEP1LA6NFU8 196 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 MCRIP1C9JLW8 97 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 LRRN3E7EW58 273 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 HMGN4O00479 90 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 SURF4O15260 269 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 SULT1B1O43704 296 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 CYTIPO60759 359 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 RGS11O94810 467 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 ECDO95905 644 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 IGHV3-9P01782 118 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 BCHEP06276 602 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 DUX4L2P0CJ85 424 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 DUX4L3P0CJ86 424 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 DUX4L4P0CJ87 422 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 DUX4L5P0CJ88 424 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 DUX4L6P0CJ89 424 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 DUX4L7P0CJ90 424 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 HPGDP15428 266 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 CELP19835 753 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 CXCL2P19875 107 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 GIFP27352 417 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 MNDAP41218 407 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 EIF1P41567 113 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF83P51522 516 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 P2RX1P51575 399 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 TAS2R43P59537 309 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 TSPAN5P62079 268 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 GNA13Q14344 377 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 MAPK14Q16539 360 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 KLHL26Q53HC5 615 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 ALG10Q5BKT4 473 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 ALG10BQ5I7T1 473 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP4-201ENST00000427230 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms