RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 IGHG1P01857 330 aa16.05■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 HPNP05981 417 aa16.05■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 SGPP2Q8IWX5 399 aa16.05■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF283Q8N7M2 679 aa16.05■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 DNASE2BQ8WZ79 361 aa16.05■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 PECRQ9BY49 303 aa16.05■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 KLRF1Q9NZS2 232 aa16.05■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 SIT1Q9Y3P8 196 aa16.05■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 C1QL1O75973 258 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 CLINT1Q14677 625 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 KISS1Q15726 138 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 CRIP3Q6Q6R5 217 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM156Q8N614 296 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 SSC4DQ8WTU2 575 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 E5RGE8 158 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 RAMP1O60894 148 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 MBPP02686 304 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 SERPINA2P20848 420 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 P2RY1P47900 373 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 PYY3Q5JQD4 70 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 SULF2Q8IWU5 870 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 PBDC1Q9BVG4 233 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 NSG2Q9Y328 171 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 PRH1P02810 166 aa16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 KLK2P20151 261 aa16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 CHATP28329 748 aa16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 SH3BGRL3Q9H299 93 aa16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 STMND1H3BQB6 276 aa16.02■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 RPS10P46783 165 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 DOK3Q7L591 496 aa16.02■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 D2HGDHQ8N465 521 aa16.02■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 POC1BQ8TC44 478 aa16.02■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 STT3BQ8TCJ2 826 aa16.02■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 FGF21Q9NSA1 209 aa16.02■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 PISDQ9UG56 409 aa16.02■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 CACNA1EQ15878 2313 aa16.02■□□□□ 0.16
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR137BO60478 399 aa16.02■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 CCL1P22362 96 aa16.02■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 ECI1P42126 302 aa16.02■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 DTX1Q86Y01 620 aa16.02■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 OR14K1Q8NGZ2 314 aa16.02■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 HPSE2Q8WWQ2 592 aa16.02■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 MR1Q95460 341 aa16.02■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 CHST5Q9GZS9 411 aa16.02■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 OPA3Q9H6K4 179 aa16.02■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 QDPRP09417 244 aa16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 PLPPR5Q32ZL2 321 aa16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 PLPP5Q8NEB5 264 aa16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 LYZL4Q96KX0 146 aa16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1B0GV50 99 aa16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1B0GW64 132 aa16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 DHRS7CA6NNS2 312 aa16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 NDUFA6P56556 154 aa16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 CDPF1Q6NVV7 123 aa16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 C6orf201Q7Z4U5 140 aa16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF383Q8NA42 475 aa16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 MUCL1Q96DR8 90 aa16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 FSCN3Q9NQT6 498 aa16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 ITGA3P26006 1051 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 DEFA6Q01524 100 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 SHBQ15464 509 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 SOHLH1Q5JUK2 328 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 PLXDC2Q6UX71 529 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 DEFB123Q8N688 67 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 RARRES2Q99969 163 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 SDHAF3Q9NRP4 125 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 PI4KAP42356 2102 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 SERPINE3A8MV23 424 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-208ENST00000424082 RRP8O43159 456 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms