RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 EDARQ9UNE0 448 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 MPC1Q9Y5U8 109 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 RTTNQ86VV8 2226 aa14.63□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 G3V3Q6 166 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 SLC22A5O76082 557 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 RGS11O94810 467 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 PDGFAP04085 211 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 CD34P28906 385 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 GABRA6Q16445 453 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 CALHM1Q8IU99 346 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 NAXEQ8NCW5 288 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 OR5AP2Q8NGF4 316 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 PPA2Q9H2U2 334 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 ST3GAL6Q9Y274 331 aa14.62□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 CEACAM18A8MTB9 384 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 ZNF732B4DXR9 585 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 LYZL6O75951 148 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 IL2RAP01589 272 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 SFTPBP07988 381 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 DTYMKP23919 212 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 ZBTB25P24278 435 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 HOXC12P31275 282 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 PIGYQ3MUY2 71 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 ZNF585AQ6P3V2 769 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 TMEM200AQ86VY9 491 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 MKXQ8IYA7 352 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 Q8NFD4 153 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 BOD1Q96IK1 185 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FAAP24Q9BTP7 215 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 EHFQ9NZC4 300 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 APC2O95996 2303 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 MED12LQ86YW9 2145 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 CHD8Q9HCK8 2581 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FAM90A10PA6NDY2 464 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FAM90A18PA6NE21 464 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FAM90A16PA6NEW6 464 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FAM90A7PA6NKC0 464 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FAM90A22PA8MWA6 464 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FAM90A12PA8MX19 464 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 PRSS44E7EML9 344 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 TOXO94900 526 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FAM90A15PP0C7V4 464 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FAM90A13PP0C7W8 464 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FAM90A14PP0C7W9 464 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FAM90A24PP0C7X0 464 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 ZNF35P13682 527 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 COX5AP20674 150 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FPR2P25090 351 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 PMELP40967 661 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 GPM6AP51674 278 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 DHODHQ02127 395 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 GRK1Q15835 563 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 ELP2Q6IA86 826 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 LPCAT3Q6P1A2 487 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 VWA1Q6PCB0 445 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 CYYR1Q96J86 154 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FAM210AQ96ND0 272 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 CRIM1Q9NZV1 1036 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 OPN4Q9UHM6 478 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 AK3Q9UIJ7 227 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 IGF2RP11717 2491 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 ZFHX4Q86UP3 3567 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 C9orf170A2RU37 121 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 OR5B21A6NL26 309 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 PDCD6O75340 191 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 SIX6O95475 246 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 C4BPBP20851 252 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 HAAOP46952 286 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 H2BFSP57053 126 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 ARPC4P59998 168 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 PPP1R1AQ13522 171 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 LHFPL1Q86WI0 220 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms