RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	DRAM2	Q6UX65	266 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	MOB3C	Q70IA8	216 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF716	A6NP11	495 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SFTPB	P07988	381 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CNR1	P21554	472 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN15	P56746	228 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	S100A10	P60903	97 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SRY	Q05066	204 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	RAB35	Q15286	201 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	OR51F2	Q8NH61	342 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	NMES1	Q9C002	83 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PSG4	Q00888	419 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SHE	Q5VZ18	495 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ATRAID	Q6UW56	229 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CT55	Q8WUE5	264 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	FOXB1	Q99853	325 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	NCKAP5	O14513	1909 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CYB561	P49447	251 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	DEFA5	Q01523	94 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	RAB32	Q13637	225 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	BORCS8	Q96FH0	119 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152		Q96M66	194 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	IER2	Q9BTL4	223 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	TM2D1	Q9BX74	207 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GW55	424 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	TOR1A	O14656	332 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	GP1BA	P07359	652 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	PIGY	Q3MUY2	71 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	TMED6	Q8WW62	240 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	NTNG2	Q96CW9	530 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	METTL9	Q9H1A3	318 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	RAB18	Q9NP72	206 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	DUX4	Q9UBX2	424 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	MSTN	O14793	375 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	BET1	O15155	118 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	GLI4	P10075	376 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	CCNO	P22674	350 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	TOMM40L	Q969M1	308 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJC13	O75165	2243 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	CST2	P09228	141 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	PTGER4	P35408	488 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	RBP2	P50120	134 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF92	Q03936	586 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	SKA3	Q8IX90	412 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	PIGC	Q92535	297 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	11.38	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	AK3	Q9UIJ7	227 aa		11.38	□□□□□ -0.59
BRF1-222	ENST00000635152	TECTA	O75443	2155 aa		11.38	□□□□□ -0.59

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