RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599471.5

USF2-211, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

TSL 3

Gene USF2, Length 1,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-211ENST00000599471 LINC01356Q8N9X3 169 aa14.73□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.73□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.73□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 SLAMF9Q96A28 289 aa14.73□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa14.73□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 SRRM5B3KS81 715 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 MAGEB3O15480 346 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 SULT1B1O43704 296 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 LHBP01229 141 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 PPP3R1P63098 170 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 ACSM1Q08AH1 577 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 KCNJ8Q15842 424 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 ESCO2Q56NI9 601 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 SLC25A26Q70HW3 274 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 RNF144BQ7Z419 303 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 FAM90A1Q86YD7 464 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 OR51A2Q8NGJ7 313 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 TMEM203Q969S6 136 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 SPSB1Q96BD6 273 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 TMIGD2Q96BF3 282 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 OR8B2Q96RD0 313 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 GPER1Q99527 375 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 MGLLQ99685 303 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 MIOXQ9UGB7 285 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa14.72□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.71□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 B4DSR2 109 aa14.71□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 ZNF879B4DU55 563 aa14.71□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 NXPH2O95156 264 aa14.71□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 CYB5AP00167 134 aa14.71□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 GABRA2P47869 451 aa14.71□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 INSL4Q14641 139 aa14.71□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 FAM166AQ6J272 317 aa14.71□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 DCDC5Q6ZRR9 648 aa14.71□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 DNAAF1Q8NEP3 725 aa14.71□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 OR51F2Q8NH61 342 aa14.71□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 CCL13Q99616 98 aa14.71□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 CKLFQ9UBR5 152 aa14.71□□□□□ -0.05
USF2-211ENST00000599471 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 ANGPTL7O43827 346 aa14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 MSMBP08118 114 aa14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 CALCBP10092 127 aa14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 PSMB9P28065 219 aa14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 PITPNBP48739 271 aa14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 SNU13P55769 128 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 RPS25P62851 125 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 GNB2P62879 340 aa14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 SPARTQ8N0X7 666 aa14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 POC1AQ8NBT0 407 aa14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 PKIBQ9C010 78 aa14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 NOX4Q9NPH5 578 aa14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 NLKQ9UBE8 527 aa14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 OR14J1Q9UGF5 321 aa14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 LRRC42Q9Y546 428 aa14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.7□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 ZANQ9Y493 2812 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 NKX6-3A6NJ46 265 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 TRAPPC2LH3BP13 241 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 TMPRSS2O15393 492 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 MAS1P04201 325 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 CD1AP06126 327 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 WNT2P09544 360 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 PGA5P0DJD9 388 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 TMEM225BP0DP42 221 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 CFHR2P36980 270 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 TGFBR2P37173 567 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 IL24Q13007 206 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 IKZF1Q13422 519 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 SMIM21Q3B7S5 101 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 DDI2Q5TDH0 399 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 ASPHD2Q6ICH7 369 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 ZNF773Q6PK81 442 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 MKXQ8IYA7 352 aa14.69□□□□□ -0.06
USF2-211ENST00000599471 OR52N4Q8NGI2 321 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms