RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598256.1

LTBP4-222, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-222	ENST00000598256	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		13.46	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	PKIB	Q9C010	78 aa		13.46	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		13.46	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		13.46	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	NOTO	A8MTQ0	251 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	IRF2	P14316	349 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	DNASE1	P24855	282 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CAV3	P56539	151 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	ZP1	P60852	638 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	SPCS2	Q15005	226 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	HES5	Q5TA89	166 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	AWAT2	Q6E213	333 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	MKX	Q8IYA7	352 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	AQP3	Q92482	292 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	HPS1	Q92902	700 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	ERGIC1	Q969X5	290 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	GCM1	Q9NP62	436 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	TREM2	Q9NZC2	230 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC17A2	O00624	439 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	SYNGR1	O43759	233 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	ANGPTL7	O43827	346 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	NDUFS7	O75251	213 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	RHBDL1	O75783	438 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	LY6H	O94772	140 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	MPZ	P25189	248 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	HTR2C	P28335	458 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	EFNA4	P52798	201 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	IL24	Q13007	206 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	RIN1	Q13671	783 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	RAB11B	Q15907	218 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	HFE	Q30201	348 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	WDR82	Q6UXN9	313 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	LRRC29	Q8WV35	223 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	SLAMF9	Q96A28	289 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256		A0A0G2JK05	382 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	LRRC30	A6NM36	301 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	IFITM5	A6NNB3	132 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	AIP	O00170	330 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	DAO	P14920	347 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	PTGFR	P43088	359 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	ATP5J2	P56134	94 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	LYPD6	Q86Y78	171 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	OR51F2	Q8NH61	342 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256		Q8TCH9	128 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CCL17	Q92583	94 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	RDH5	Q92781	318 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	PERP	Q96FX8	193 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	DLL4	Q9NR61	685 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	ING4	Q9UNL4	249 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CACNG2	Q9Y698	323 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256		A6NHS1	94 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	IFNL4	K9M1U5	179 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	AKR7A2	O43488	359 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	IGHV4-39	P01824	125 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	SOX6	P35712	828 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	RANBP1	P43487	201 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	PTH2R	P49190	550 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CLDN12	P56749	244 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	P2RY14	Q15391	338 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	RSU1	Q15404	277 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	IDNK	Q5T6J7	187 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	BATF2	Q8N1L9	274 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26

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