RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 HMGA2P52926 109 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 ACTR3P61158 418 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SLC3A1Q07837 685 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 TSPAN31Q12999 210 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 OPCMLQ14982 345 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 HIST3H3Q16695 136 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 MICAQ29983 383 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 OTPQ5XKR4 325 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 FAM122BQ7Z309 247 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 STHQ8IWL8 128 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 OR8D4Q8NGM9 314 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 OR4A16Q8NH70 328 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 LGALS12Q96DT0 336 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 NGBQ9NPG2 151 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 A0A096LNT2 108 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SHISA9B4DS77 424 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 E2F6O75461 281 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 CD79AP11912 226 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 PRKACGP22612 351 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 IFNGR2P38484 337 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 RIPK1Q13546 671 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 RFX4Q33E94 735 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 C10orf128Q5T292 105 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 MDP1Q86V88 176 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SKA3Q8IX90 412 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 LRRC18Q8N456 261 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SH3GL3Q99963 347 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.4□□□□□ -1.38
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ATG4D-210ENST00000588972 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 NTN4Q9HB63 628 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 PRSS37A4D1T9 235 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 A6NIZ1 184 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 CENPBD1B2RD01 187 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 XKRYO14609 159 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 GPRIN2O60269 458 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 CECR9P0C854 216 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 CTLA4P16410 223 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 CALCRP30988 508 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 RAP1BP61224 184 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 RAP1AP62834 184 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 SGCAQ16586 387 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 PGGHGQ32M88 737 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 SLC36A3Q495N2 470 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 LEG1Q6P5S2 330 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 LINC00471Q8N535 108 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 OR4K13Q8NH42 304 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 GIPC3Q8TF64 312 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 STMN2Q93045 179 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 NABP1Q96AH0 204 aa6.39□□□□□ -1.39
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