RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 GPER1Q99527 375 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 SELENOIQ9C0D9 397 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 POFUT1Q9H488 388 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHG3P01860 377 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF81P51508 661 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 PLGLB1Q02325 96 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A42Q86VD7 318 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 ARRDC1Q8N5I2 433 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM251Q8N6I4 163 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC6A7Q99884 636 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 SOX7Q9BT81 388 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 PDZD2O15018 2839 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 M0QYG6 137 aa22.06■■□□□ 1.12
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CAPNS1-204ENST00000587718 PRKACBP22694 351 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 OR3A4PP47883 348 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC18Q8N456 261 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 RPRMLQ8N4K4 120 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXB1Q99853 325 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 CRLF2Q9HC73 371 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 PARPBPQ9NWS1 579 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 CEACAM18A8MTB9 384 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 MFNGO00587 321 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A5O76082 557 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 IL2RAP01589 272 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 TAS2R31P59538 309 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52B4Q8NGK2 314 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 POM121Q96HA1 1249 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 TECTBQ96PL2 329 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 GAL3ST1Q99999 423 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM165Q9HC07 324 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR35Q9HC97 309 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 LIPGQ9Y5X9 500 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 DCHS2Q6V1P9 2916 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 PKDREJQ9NTG1 2253 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC00862A6NCI5 91 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 M0R233 179 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 SSX5O60225 188 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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CAPNS1-204ENST00000587718 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM211Q6ICI0 200 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 SGK3Q96BR1 496 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 SCGB3A2Q96PL1 93 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 SPOCK3Q9BQ16 436 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 CHIAQ9BZP6 476 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 COQ3Q9NZJ6 369 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0A6YYD4 124 aa22.04■■□□□ 1.12
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CAPNS1-204ENST00000587718 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa22.04■■□□□ 1.12
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CAPNS1-204ENST00000587718 KCNK7Q9Y2U2 307 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 MCRIP1C9JLW8 97 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 FARS2O95363 451 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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CAPNS1-204ENST00000587718 CELA3AP09093 270 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 CPT2P23786 658 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 GFOD2Q3B7J2 385 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 CRIP3Q6Q6R5 217 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM104Q8NE00 496 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 ROBO4Q8WZ75 1007 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 CMBLQ96DG6 245 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 S100A13Q99584 98 aa22.03■■□□□ 1.12
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF407Q9C0G0 2248 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 L7N2F9 121 aa22.02■■□□□ 1.12
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CAPNS1-204ENST00000587718 UBE2V2Q15819 145 aa22.02■■□□□ 1.12
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR2H1Q9GZK4 316 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 CHST6Q9GZX3 395 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 UBQLN2Q9UHD9 624 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 AUP1Q9Y679 476 aa22.02■■□□□ 1.12
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF724A8MTY0 619 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 GOSR2O14653 212 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 TSC22D2O75157 780 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 CD8AP01732 235 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB25P24278 435 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 NTF4P34130 210 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 STARP49675 285 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM50BP56557 158 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 H2BFSP57053 126 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 CEACAM16Q2WEN9 425 aa22.01■■□□□ 1.11
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