RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 MEGF9Q9H1U4 602 aa9.63□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 DPAGT1Q9H3H5 408 aa9.63□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 HES4Q9HCC6 221 aa9.63□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC22A13Q9Y226 551 aa9.63□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa9.63□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 R4GMQ9 66 aa9.63□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 A6NIN4 97 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 NKX6-3A6NJ46 265 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 G3V2T6 193 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 FBP1P09467 338 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 CCL1P22362 96 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 MPZP25189 248 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 PAX6P26367 422 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 PRDX2P32119 198 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 ERVK11-1P61568 191 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 DEFA6Q01524 100 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 ACSM1Q08AH1 577 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 LCN1P1Q5VSP4 162 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 C17orf107Q6ZR85 190 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 CALHM1Q8IU99 346 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC35F2Q8IXU6 374 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 BEND2Q8NDZ0 799 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 PPP1R35Q8TAP8 253 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 IL4I1Q96RQ9 567 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 NRIP2Q9BQI9 281 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 TEX12Q9BXU0 123 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 GPR173Q9NS66 373 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 CLN6Q9NWW5 311 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 ENPP5Q9UJA9 477 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 OR52A1Q9UKL2 312 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM96BQ9Y3D0 163 aa9.62□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 MEIOCA2RUB1 952 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC22A31A6NKX4 558 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 F8VVB4 439 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 F8VWA3 439 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 DLGAP1O14490 977 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 HAAOP46952 286 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 DLX6P56179 175 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 EGR3Q06889 387 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 CLVS2Q5SYC1 327 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 PLCXD3Q63HM9 321 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 THAP5Q7Z6K1 395 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 AMIGO2Q86SJ2 522 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 ANGPTL5Q86XS5 388 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 MKXQ8IYA7 352 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 RORBQ92753 470 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 MNTQ99583 582 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 KRT84Q9NSB2 600 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 IKZF2Q9UKS7 526 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 SNX5Q9Y5X3 404 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 TGP01266 2768 aa9.61□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1W2PQ09 198 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 DHRS7CA6NNS2 312 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 E9PQ18 207 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 J3QT63 122 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 TGFBR2P37173 567 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 UBE2V2Q15819 145 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 MIDNQ504T8 468 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 BRICD5Q6PL45 260 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 CATSPERDQ86XM0 798 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF573Q86YE8 665 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 BATF2Q8N1L9 274 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 OR5D13Q8NGL4 314 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 LRTOMTQ8WZ04 291 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 UBE2FQ969M7 185 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 CIB1Q99828 191 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 FBLN5Q9UBX5 448 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 AP4S1Q9Y587 144 aa9.6□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 H0YAE9 185 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF737O75373 536 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 TK1P04183 234 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 CCL3L1P16619 93 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 FASP25445 335 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 ISL1P61371 349 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF273Q14593 569 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 BCL2L15Q5TBC7 163 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 ASRGL1Q7L266 308 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 COMMD2Q86X83 199 aa9.59□□□□□ -0.87
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM185AQ8N0U4 392 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms