RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527644.1

TSPAN4-217, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-217ENST00000527644 GALEQ14376 348 aa21.79■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 GPR157Q5UAW9 335 aa21.79■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 RDH10Q8IZV5 341 aa21.79■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 LY6G5BQ8NDX9 201 aa21.79■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 AMBNQ9NP70 447 aa21.79■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 ESM1Q9NQ30 184 aa21.79■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 INPP5EQ9NRR6 644 aa21.79■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 FRRS1LQ9P0K9 344 aa21.79■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 SYNGR1O43759 233 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 ISG15P05161 165 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 SFTPBP07988 381 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 HTR1AP08908 422 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 PGA5P0DJD9 388 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 PSG2P11465 335 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 MPZP25189 248 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 GABRA2P47869 451 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 CCR9P51686 369 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 UBE2V2Q15819 145 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 LPCAT4Q643R3 524 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 ACP7Q6ZNF0 438 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 LHFPL3Q86UP9 236 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 APH1BQ8WW43 257 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 PELI1Q96FA3 418 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 C4orf36Q96KX1 117 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 TBX15Q96SF7 602 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 ALG8Q9BVK2 526 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 CHST5Q9GZS9 411 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 SIRPDQ9H106 197 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 MYRFQ9Y2G1 1151 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 IGHA1P01876 353 aa21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 SELLP14151 372 aa21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 ARF6P62330 175 aa21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 RCN1Q15293 331 aa21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 DGUOKQ16854 277 aa21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 LRRC36Q1X8D7 754 aa21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 SMIM21Q3B7S5 101 aa21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 KLHL22Q53GT1 634 aa21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 SYS1Q8N2H4 156 aa21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 PACRGLQ8N7B6 248 aa21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 PP6455Q8WZ26 134 aa21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 DCTN5Q9BTE1 182 aa21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 PKIBQ9C010 78 aa21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF222Q9UK12 451 aa21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 KPTNQ9Y664 436 aa21.77■■□□□ 1.08
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa21.76■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 TFF1P04155 84 aa21.76■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 FUT6P51993 359 aa21.76■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 CAV3P56539 151 aa21.76■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 PDCD1Q15116 288 aa21.76■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 C8orf46Q8TAG6 207 aa21.76■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 SDSLQ96GA7 329 aa21.76■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF488Q96MN9 340 aa21.76■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 NRIP2Q9BQI9 281 aa21.76■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 UBA52P62987 128 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 IL24Q13007 206 aa21.75■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 TTC23Q5W5X9 447 aa21.75■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 BRD3OSQ6XYD6 125 aa21.75■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 ANGPTL5Q86XS5 388 aa21.75■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 CALHM1Q8IU99 346 aa21.75■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 OR52I1Q8NGK6 324 aa21.75■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF649Q9BS31 505 aa21.75■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 ERVK13-1Q9NX77 482 aa21.75■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 WBP4O75554 376 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 NXPH2O95156 264 aa21.74■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 BAMBIQ13145 260 aa21.74■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF691Q5VV52 312 aa21.74■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 NPRL2Q8WTW4 380 aa21.74■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 HHLA2Q9UM44 414 aa21.74■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 MAB21L2Q9Y586 359 aa21.74■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa21.73■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 RFPL4AA6NLU0 287 aa21.73■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 OR4C45A6NMZ5 311 aa21.73■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa21.73■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 NDUFB7P17568 137 aa21.73■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 PRTN3P24158 256 aa21.73■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 PEX2P28328 305 aa21.73■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 ACTG1P63261 375 aa21.73■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 CMTM4Q8IZR5 234 aa21.73■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 KIR3DL3Q8N743 410 aa21.73■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNRF1Q8ND25 227 aa21.73■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 BORCS8Q96FH0 119 aa21.73■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 HES4Q9HCC6 221 aa21.73■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 ONECUT1Q9UBC0 465 aa21.73■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 RPSAP08865 295 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 ERVK11-1P61568 191 aa21.72■■□□□ 1.07
TSPAN4-217ENST00000527644 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms