RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ELOCQ15369 112 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAPRE2Q15555 327 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR1Q1Q15612 314 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM241Q24JQ0 296 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STEAP4Q687X5 459 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C16orf87Q6PH81 154 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LCA10Q71F78 164 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CMTM1Q8IZ96 169 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR5H2Q8NGV7 314 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR151Q8TDV0 419 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BAALCQ8WXS3 180 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DTNBP1Q96EV8 351 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DYNLL2Q96FJ2 89 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMARCD1Q96GM5 515 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TPPP3Q9BW30 176 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM38AQ9H6F2 299 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RHOFQ9HBH0 211 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLAC8Q9NZF1 115 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC23A2Q9UGH3 650 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIF16BQ96L93 1317 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCPQ6ZWJ8 1503 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNIKQ9UKE5 1360 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A075B6Q4 140 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1W2PRG6 482 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM170AA1A519 330 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CACNG3O60359 315 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SH2D1AO60880 128 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CTNSO60931 367 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFNB1P01574 187 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDK1P06493 297 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALOX5APP20292 161 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HTR2CP28335 458 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXN2P32314 431 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRYBB2P43320 205 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 INAQ16352 499 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSMD5Q16401 504 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C10orf91Q5T1B1 145 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ELP2Q6IA86 826 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CERS6Q6ZMG9 384 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC22A9Q8IVM8 553 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR9K2Q8NGE7 335 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR6K6Q8NGW6 343 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF133Q8WVZ7 376 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CAPSLQ8WWF8 208 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RXFP2Q8WXD0 754 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RLN3Q8WXF3 142 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM131CQ96AQ9 280 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPEQ96AT9 228 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ECHDC3Q96DC8 303 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PYURFQ96I23 114 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC35G5Q96KT7 338 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MFSD1Q9H3U5 465 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RMND5AQ9H871 391 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM100Q9NV29 134 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00588Q9Y4M8 146 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HMCN2Q8NDA2 5059 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLUHO75153 1309 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RTTNQ86VV8 2226 aa-0.7□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTPRKQ15262 1439 aa-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR52A4PA6NMU1 304 aa-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKRD65E5RJM6 399 aa-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 J3QQQ9 107 aa-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 M0R3G1 203 aa-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDYNP01213 254 aa-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL9P15248 144 aa-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYL9P24844 172 aa-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HTR2BP41595 481 aa-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUDT2P50583 147 aa-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL26P61254 145 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADIGQ0VDE8 80 aa-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAM2Q15035 370 aa-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDK5R1Q15078 307 aa-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NNATQ16517 81 aa-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF773Q6PK81 442 aa-0.71□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IQCKQ8N0W5 287 aa-0.71□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms