RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 TAS2R13Q9NYV9 303 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 PPIAL4EA0A075B759 164 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 A0A087WZ39 114 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ISPDA4D126 451 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 NKX6-3A6NJ46 265 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 OR6C65A6NJZ3 312 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 B4DXG7 233 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 M0R233 179 aa3.51□□□□□ -1.85
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PDE4D-217ENST00000509355 FOXH1O75593 365 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 SCELO95171 688 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 TTC4O95801 387 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 PPIAL4FP0DN26 164 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 FOLR2P14207 255 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 CPMP14384 443 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 BCL3P20749 454 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 MSR1P21757 451 aa3.51□□□□□ -1.85
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PDE4D-217ENST00000509355 UCP1P25874 307 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 FHITP49789 147 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 SLC7A2P52569 658 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 BLVRAP53004 296 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 CLDN8P56748 225 aa3.51□□□□□ -1.85
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PDE4D-217ENST00000509355 HAGHQ16775 308 aa3.51□□□□□ -1.85
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PDE4D-217ENST00000509355 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 CPTPQ5TA50 214 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 PLCXD3Q63HM9 321 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF730Q6ZMV8 503 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 MICU2Q8IYU8 434 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ABHD12Q8N2K0 398 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 WDR31Q8NA23 367 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ICA1LQ8NDH6 482 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 C8orf46Q8TAG6 207 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 MAIP1Q8WWC4 291 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ST8SIA1Q92185 356 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 UBE2E3Q969T4 207 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 SGK3Q96BR1 496 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 TIMD4Q96H15 378 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 PRRC1Q96M27 445 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 SLC38A2Q96QD8 506 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 MS4A8Q9BY19 250 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 SRXN1Q9BYN0 137 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 CHIAQ9BZP6 476 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 TSGA10Q9BZW7 698 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 OR51B5Q9H339 312 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 RGCCQ9H4X1 137 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 SLC17A5Q9NRA2 495 aa3.51□□□□□ -1.85
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PDE4D-217ENST00000509355 EMC3Q9P0I2 261 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 CTSZQ9UBR2 303 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF639Q9UID6 485 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ABCG2Q9UNQ0 655 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 SELENOKQ9Y6D0 94 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 NINQ8N4C6 2090 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa3.5□□□□□ -1.85
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF724A8MTY0 619 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 KLLNB2CW77 178 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 CLDN25C9JDP6 229 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 SLC1A7O00341 560 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 PLPP1O14494 284 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 EI24O14681 340 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 IMPA2O14732 288 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ANGPTL1O95841 491 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 IGHV2-5P01817 119 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 CRYGBP07316 175 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 PRKACBP22694 351 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 EDNRAP25101 427 aa3.5□□□□□ -1.85
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PDE4D-217ENST00000509355 SLC1A2P43004 574 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 MARCKSL1P49006 195 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 BTG1P62324 171 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 BASP1P80723 227 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 IRF8Q02556 426 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF154Q13106 437 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 HERPUD1Q15011 391 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 DEFB112Q30KQ8 113 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 Q3ZCU0 254 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 FAM74A3Q4VXF1 159 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 HIKESHIQ53FT3 197 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 C8orf74Q6P047 294 aa3.5□□□□□ -1.85
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