RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 Q71RC1 249 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 CEACAM19Q7Z692 300 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 SPICQ8N5J4 248 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 OR5D18Q8NGL1 313 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 WNT9BO14905 357 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 SYNGR1O43759 233 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 MAS1P04201 325 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 CD1AP06126 327 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM225BP0DP42 221 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 EGR1P18146 543 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 GLRA1P23415 457 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 TGFBR2P37173 567 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 GPR50Q13585 617 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 TPBGQ13641 420 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAM1Q15629 374 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNJ8Q15842 424 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 UBE2UQ5VVX9 321 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC25A26Q70HW3 274 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 KRT74Q7RTS7 529 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 PHC2Q8IXK0 858 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 DNAAF1Q8NEP3 725 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 CLDND2Q8NHS1 167 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 AQP3Q92482 292 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 SLAMF9Q96A28 289 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 C18orf12Q96KH6 178 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF488Q96MN9 340 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 DERL3Q96Q80 235 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 SLITRK2Q9H156 845 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 TLNRD1Q9H1K6 362 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 TCF7L1Q9HCS4 588 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 NOX4Q9NPH5 578 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 SNTG1Q9NSN8 517 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 OOEPA6NGQ2 149 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 LGALS8O00214 317 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 CCRL2O00421 344 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 NXPH2O95156 264 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV2-70P01814 119 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 INHBBP09529 407 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 FOSL1P15407 271 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 RPS2P15880 293 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 PCMT1P22061 227 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 BDKRB2P30411 391 aa11.24□□□□□ -0.61
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PGGT1B-204ENST00000503638 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 MICBQ29980 383 aa11.24□□□□□ -0.61
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PGGT1B-204ENST00000503638 DDI2Q5TDH0 399 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 NLRC3Q7RTR2 1065 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 CALHM1Q8IU99 346 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 C11orf53Q8IXP5 236 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 JAGN1Q8N5M9 183 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 GCSAMQ8N6F7 178 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 OR51A2Q8NGJ7 313 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 TMIGD2Q96BF3 282 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 RAB39BQ96DA2 213 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF665Q9H7R5 613 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF696Q9H7X3 374 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 LPAR2Q9HBW0 351 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM138Q9NPI0 162 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 TANC2Q9HCD6 1990 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 JMJD1CQ15652 2540 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 NKX6-3A6NJ46 265 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAPPC2LH3BP13 241 aa11.23□□□□□ -0.61
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PGGT1B-204ENST00000503638 GYPAP02724 150 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 IL2RGP31785 369 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 SNU13P55769 128 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 KISS1Q15726 138 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 SMIM21Q3B7S5 101 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM76BQ5HYJ3 339 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM27D1Q5T7N8 215 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 MKXQ8IYA7 352 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 OR5T2Q8NGG2 359 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 OR52N4Q8NGI2 321 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 OR10Z1Q8NGY1 313 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 COX4I2Q96KJ9 171 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 CEP19Q96LK0 163 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 S100A13Q99584 98 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 PKIBQ9C010 78 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-204ENST00000503638 WDR13Q9H1Z4 485 aa11.23□□□□□ -0.61
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