RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	BATF2	Q8N1L9	274 aa		14.79	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	BORCS8	Q96FH0	119 aa		14.79	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	ZNF488	Q96MN9	340 aa		14.79	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		14.79	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	DHDH	Q9UQ10	334 aa		14.79	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		14.79	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	COL6A5	A8TX70	2615 aa		14.79	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	SLC1A7	O00341	560 aa		14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	MYL12B	O14950	172 aa		14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	INMT	O95050	263 aa		14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	IFNA2	P01563	188 aa		14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	GABRA2	P47869	451 aa		14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	NPY4R	P50391	375 aa		14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	CCDC58	Q4VC31	144 aa		14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	XAF1	Q6GPH4	301 aa		14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR52N1	Q8NH53	320 aa		14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	MRI1	Q9BV20	369 aa		14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	NLK	Q9UBE8	527 aa		14.78	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	OR2AT4	A6NND4	320 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	DVL1	O14640	695 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	NXPH2	O95156	264 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	AVP	P01185	164 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ADRA2C	P18825	462 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ATF1	P18846	271 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	PRKACB	P22694	351 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	MYF6	P23409	242 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	VHL	P40337	213 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SOX2	P48431	317 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	MTCP1	P56278	107 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	IKZF1	Q13422	519 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	CDK5R1	Q15078	307 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	CD276	Q5ZPR3	534 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	CALHM1	Q8IU99	346 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	TEX29	Q8N6K0	151 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	POC1A	Q8NBT0	407 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ST8SIA4	Q92187	359 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	MYDGF	Q969H8	173 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	CNBD2	Q96M20	576 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		14.77	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902		A0A1B0GW55	424 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	NDUFB3	O43676	98 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	LALBA	P00709	142 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	TFF1	P04155	84 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	RBP2	P50120	134 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ATP1B3	P54709	279 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	STUM	Q69YW2	141 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	UTS2B	Q765I0	119 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	GPR148	Q8TDV2	347 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	RASL12	Q9NYN1	266 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	DUX4	Q9UBX2	424 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	AUP1	Q9Y679	476 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	CUBN	O60494	3623 aa		14.76	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	CYB5A	P00167	134 aa		14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	CDK1	P06493	297 aa		14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	PGA5	P0DJD9	388 aa		14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	POU3F4	P49335	361 aa		14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		14.75	□□□□□ -0.05

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