RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	ATP1B3	P54709	279 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	GNB2	P62879	340 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	CR1L	Q2VPA4	569 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	CLN8	Q9UBY8	286 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241	DHDH	Q9UQ10	334 aa		12.21	□□□□□ -0.45
PTPA-222	ENST00000445241		A6NIN4	97 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	PTGES3L	E9PB15	166 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	GLRA1	P23415	457 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	CRHBP	P24387	322 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	CD276	Q5ZPR3	534 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	STUM	Q69YW2	141 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	XAF1	Q6GPH4	301 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF529	Q6P280	563 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241		Q8IYB0	196 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	MED30	Q96HR3	178 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	OPALIN	Q96PE5	141 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	BEX2	Q9BXY8	128 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	RHOF	Q9HBH0	211 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	NF1	P21359	2839 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	ZFHX3	Q15911	3703 aa		12.2	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	AKR7A2	O43488	359 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	ADAM20	O43506	726 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	RGS10	O43665	173 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	SULT1B1	O43704	296 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	RHBDL1	O75783	438 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	GYPA	P02724	150 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	OCM2	P0CE71	109 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	FAM157C	P0CG43	387 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	LCN2	P80188	198 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	SCGB2A2	Q13296	93 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	GPR50	Q13585	617 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	IRF3	Q14653	427 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	MKX	Q8IYA7	352 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	GHSR	Q92847	366 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	CNBD2	Q96M20	576 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	HES4	Q9HCC6	221 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	NLK	Q9UBE8	527 aa		12.19	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	JMJD1C	Q15652	2540 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	OR2AT4	A6NND4	320 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241		H3BSH0	61 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	TMPRSS2	O15393	492 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	CYB5A	P00167	134 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	LALBA	P00709	142 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	LIPF	P07098	398 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	MTCP1	P56278	107 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	ERVK11-1	P61568	191 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	PAX2	Q02962	417 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	SPHAR	Q15513	63 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241		Q499Y3	187 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		12.18	□□□□□ -0.46
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		12.18	□□□□□ -0.46

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