RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 GNB2P62879 340 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 LCN2P80188 198 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 ACSM1Q08AH1 577 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 MED22Q15528 200 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 ANGPTL5Q86XS5 388 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 OR13C9Q8NGT0 318 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 TMIGD2Q96BF3 282 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 OPALINQ96PE5 141 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 ADAM20O43506 726 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 ALX3O95076 343 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 MT-ND2P03891 347 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 CD1AP06126 327 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 PITPNBP48739 271 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 IL24Q13007 206 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 IRF3Q14653 427 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM106AQ96A25 262 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 WDR13Q9H1Z4 485 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 CLN8Q9UBY8 286 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.265e-7■■■■□ 21.4
FAAP20-204ENST00000400919 A0A0G2JMP0 313 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 A0A0X1KG70 313 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 SULT1B1O43704 296 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 GATA3P23771 443 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 NPY4RP50391 375 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 LYPD2Q6UXB3 125 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 CALHM1Q8IU99 346 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 POC1AQ8NBT0 407 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 OR4M2Q8NGB6 313 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 PGLYRP3Q96LB9 341 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 OR5V1Q9UGF6 321 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 A8MXK9 166 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 TMPRSS2O15393 492 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 SYNGR1O43759 233 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 CYB5AP00167 134 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 PGA5P0DJD9 388 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 HNF1AP20823 631 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 SMIM21Q3B7S5 101 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 Q499Y3 187 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 SHARPINQ9H0F6 387 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 DNTTIP1Q9H147 329 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 NLKQ9UBE8 527 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 KAAG1Q9UBP8 84 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 LPAR3Q9UBY5 353 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-204ENST00000400919 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 MAGEB3O15480 346 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 RAB3AP20336 220 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 THRSPQ92748 146 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 SEH1LQ96EE3 360 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 FAHD2AQ96GK7 314 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 OR5M11Q96RB7 305 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 SNTG1Q9NSN8 517 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 NXPH2O95156 264 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 HCKP08631 526 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 GABARAPL2P60520 117 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 CR1LQ2VPA4 569 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 DCAF12L2Q5VW00 463 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 MKXQ8IYA7 352 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 NRIP2Q9BQI9 281 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 CKLFQ9UBR5 152 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 SONP18583 2426 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 NKX6-3A6NJ46 265 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 OR2AT4A6NND4 320 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 PLATP00750 562 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 PPP3R1P63098 170 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 GPR50Q13585 617 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 FAM120AOSQ5T036 256 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 STUMQ69YW2 141 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 SLC25A26Q70HW3 274 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 MS4A15Q8N5U1 240 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 OR5T2Q8NGG2 359 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 CCL13Q99616 98 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 BEX2Q9BXY8 128 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 CRLF1O75462 422 aa22.86■■□□□ 1.25
FAAP20-204ENST00000400919 HSMCR30P0CW71 290 aa22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms