RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397611.7

PTPRD-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 8,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-205ENST00000397611 CDC14CA4D256 554 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 WDR38Q5JTN6 314 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 LY6G6FQ5SQ64 297 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 NPSR1Q6W5P4 371 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 Q7L0L9 218 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 OR8U1Q8NH10 309 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 SPTA1P02549 2419 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 VSTM2BA6NLU5 285 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 ST8SIA5O15466 376 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 VSIG10L2P0DP72 767 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 PVRP15151 417 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 MALLQ13021 153 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 TMEM128Q5BJH2 165 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 ZNF519Q8TB69 540 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 MS4A10Q96PG2 267 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 TECTBQ96PL2 329 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 CHST6Q9GZX3 395 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 RAB18Q9NP72 206 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 LRIT1Q9P2V4 623 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 TTC28Q96AY4 2481 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 A0A1B0GTH9 108 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 TMEM14DPA8MWL7 114 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 C17orf112F2Z3M2 114 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 GPR37O15354 613 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 FBP1P09467 338 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 PMCHP20382 165 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 CLDN34H7C241 214 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 CLN5O75503 358 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 CLDN1O95832 211 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 MDKP21741 143 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 EGR4Q05215 589 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 MESTQ5EB52 335 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF542PQ5EBM4 170 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 C8orf44Q96CB5 159 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 ACRP10323 421 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 Q6ZSR3 168 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 ADAP1O75689 374 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 SFT2D2O95562 160 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 RAC2P15153 192 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 HHEXQ03014 270 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 C1orf61Q13536 156 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 OR8G2PQ6IF36 304 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 CATSPERDQ86XM0 798 aa4.84□□□□□ -1.63
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