RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 ST8SIA4Q92187 359 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF488Q96MN9 340 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 JMJD8Q96S16 334 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 JAM3Q9BX67 310 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 PKIBQ9C010 78 aa13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 A0A1B0GVI7 797 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLDN34H7C241 214 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRIM77I1YAP6 450 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 HAAOP46952 286 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 CAV3P56539 151 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 IL13RA1P78552 427 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 GALEQ14376 348 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 BRD3OSQ6XYD6 125 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF573Q86YE8 665 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 SYS1Q8N2H4 156 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 CD177Q8N6Q3 437 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIR3DL3Q8N743 410 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 OR10AC1Q8NH08 325 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF671Q8TAW3 534 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 C10orf35Q96D05 121 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 AMBNQ9NP70 447 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 RASL12Q9NYN1 266 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 DNAJB11Q9UBS4 358 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 KPTNQ9Y664 436 aa13.44□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 DAPL1A0PJW8 107 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 F8VVB4 439 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 F8VWA3 439 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 H3BSH0 61 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 NDUFB3O43676 98 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 TOX4O94842 621 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 LIMS3P0CW19 117 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 LIMS4P0CW20 117 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRTN3P24158 256 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 PEX2P28328 305 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 BPIFB3P59826 476 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARF6P62330 175 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 RAB40BQ12829 278 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 IL24Q13007 206 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 IKZF1Q13422 519 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF691Q5VV52 312 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 LPCAT4Q643R3 524 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM220AQ7Z4H9 259 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 OR52I1Q8NGK6 324 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 TNFRSF14Q92956 283 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMIGD2Q96BF3 282 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 C4orf36Q96KX1 117 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 PCGF1Q9BSM1 259 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 ALG8Q9BVK2 526 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 CNTD2Q9H8S5 307 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 ERVK13-1Q9NX77 482 aa13.43□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 BAG2O95816 211 aa13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 ACTA2P62736 377 aa13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 ACTG2P63267 376 aa13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC9A3R2Q15599 337 aa13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 DEFB112Q30KQ8 113 aa13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 LRRC10Q5BKY1 277 aa13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM244Q5VVB8 128 aa13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 UTS2BQ765I0 119 aa13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 LHFPL3Q86UP9 236 aa13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 PACRGLQ8N7B6 248 aa13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNRF1Q8ND25 227 aa13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 OR51A4Q8NGJ6 313 aa13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 RPS4Y2Q8TD47 263 aa13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 MED30Q96HR3 178 aa13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 Q96MT0 163 aa13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 INPP5EQ9NRR6 644 aa13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 MTCH1Q9NZJ7 389 aa13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 NKX6-3A6NJ46 265 aa13.41□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 SNTNA6NMZ2 147 aa13.41□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 E9PI62 339 aa13.41□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLIC3O95833 236 aa13.41□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 PDCD1Q15116 288 aa13.41□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 RCN1Q15293 331 aa13.41□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 SMIM21Q3B7S5 101 aa13.41□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 LAIR2Q6ISS4 152 aa13.41□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 RNF144BQ7Z419 303 aa13.41□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANGPTL5Q86XS5 388 aa13.41□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 PIP4P2Q8N4L2 257 aa13.41□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 DNAAF1Q8NEP3 725 aa13.41□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 PP6455Q8WZ26 134 aa13.41□□□□□ -0.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms