RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.41□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.41□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.41□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 OR1P1Q8NH06 330 aa6.41□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 TMEM239Q8WW34 195 aa6.41□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.41□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.41□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.41□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.41□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.41□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 LRP12Q9Y561 859 aa6.41□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 SCN3AQ9NY46 2000 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 SLC16A5O15375 505 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 ST6GAL1P15907 406 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 ZBTB25P24278 435 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 CXCR1P25024 350 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 CCKARP32238 428 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 BIDP55957 195 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 HERV-K104P63124 156 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 RHOGP84095 191 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 COMMD2Q86X83 199 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 MITD1Q8WV92 249 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 C4orf36Q96KX1 117 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 NICN1Q9BSH3 213 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 GPR35Q9HC97 309 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 FAM60AQ9NP50 221 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 STARD5Q9NSY2 213 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 UPB1Q9UBR1 384 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.4□□□□□ -1.38
CCR6-202ENST00000349984 A0A087WWC5 75 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 TRBC2A0A5B9 178 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 CSF1P09603 554 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 IFI6P09912 130 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 LIMS3P0CW19 117 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 LIMS4P0CW20 117 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 PGAM2P15259 253 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 FAHP16930 419 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 BMP5P22003 454 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 AQP2P41181 271 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 LPAR6P43657 344 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 CDK5Q00535 292 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 SLC17A1Q14916 467 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 OR7A5Q15622 319 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 SFXN5Q8TD22 340 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 STRADBQ9C0K7 418 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 P2RY12Q9H244 342 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 ASB6Q9NWX5 421 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 C1orf226A1L170 272 aa6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 FFAR1O14842 300 aa6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 GNG7O60262 68 aa6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 STK16O75716 305 aa6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 SCGB1D1O95968 90 aa6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 IFNW1P05000 195 aa6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 FURINP09958 794 aa6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 SLC35E2P0CK97 266 aa6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 LIFP15018 202 aa6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 NSG1P42857 185 aa6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 MLF1P58340 268 aa6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 ZNF763Q0D2J5 394 aa6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.39□□□□□ -1.39
CCR6-202ENST00000349984 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
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