RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 SFT2D2O95562 160 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 HGDQ93099 445 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 PLA2G10O15496 165 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 OR10X1Q8NGY0 326 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 ST6GAL2Q96JF0 529 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 PDCD6O75340 191 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 CBR1P16152 277 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 P2RX3P56373 397 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 NHLRC1Q6VVB1 395 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 FAM58AQ8N1B3 248 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 FBLIM1Q8WUP2 373 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 WDR54Q9H977 334 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 ACKR3P25106 362 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 LIMK1P53667 647 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 OR8U1Q8NH10 309 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 ASB5Q8WWX0 329 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 CLDN23Q96B33 292 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 ABCD4O14678 606 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 CD37P11049 281 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 PDZK1IP1Q13113 114 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 UCN2Q96RP3 112 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 SPRY3O43610 288 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 CT45A6P0DMU7 189 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 CT45A5P0DMU8 189 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 CT45A7P0DMV0 189 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 FOXC1Q12948 553 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 CT45A1Q5HYN5 189 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 TMEM123Q8N131 208 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 CT45A3Q8NHU0 189 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 UMAD1C9J7I0 102 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 H3BP45 60 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 DEFA4P12838 97 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 AANATQ16613 207 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 RAB18Q9NP72 206 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 CKAP5Q14008 2032 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 CNIH1O95406 144 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 MT-ND4LP03901 98 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 PNLIPP16233 465 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 RTL8BQ17RB0 113 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 RNF133Q8WVZ7 376 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 PRRX2Q99811 253 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 DCTN6O00399 190 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 LYZL6O75951 148 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 CLLU1Q5K131 121 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 PMS2CLQ68D20 193 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 FAM122CQ6P4D5 195 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 GFRALQ6UXV0 394 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 SLC26A10Q8NG04 563 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 OR2Z1Q8NG97 314 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP18.34■□□□□ 0.535e-8■■■■■ 37.7
NISCH-201ENST00000345716 OR5AP2Q8NGF4 316 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 TAAR6Q96RI8 345 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 LAMP3Q9UQV4 416 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 DSPPQ9NZW4 1301 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 ASAH2BP0C7U1 165 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 GGTLC2Q14390 218 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 MED9Q9NWA0 146 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 F6UZH7 168 aa18.33■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 SMIM10L1P0DMW3 83 aa18.33■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 S100A7P31151 101 aa18.33■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 ADAM5Q6NVV9 412 aa18.33■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 SMIM10Q96HG1 83 aa18.33■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 SLC35E1Q96K37 410 aa18.33■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 NDRG3Q9UGV2 375 aa18.33■□□□□ 0.53
NISCH-201ENST00000345716 IL34Q6ZMJ4 242 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 LHX4Q969G2 390 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 AP1S3Q96PC3 154 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 LIFP15018 202 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 MPPED2Q15777 294 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 CST7O76096 145 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 NGFP01138 241 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 ZNF83P51522 516 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 IFITM3Q01628 133 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 RFLNBQ8N5W9 214 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 PECRQ9BY49 303 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 MAGEA5P43359 124 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 PXDC1Q5TGL8 231 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 TUSC5Q8IXB3 177 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 ERGIC1Q969X5 290 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 SOCS1O15524 211 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
NISCH-201ENST00000345716 NGFRP08138 427 aa18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms