RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 C1orf210Q8IVY1 113 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 LHFPL5Q8TAF8 219 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 MAFIPQ8WZ33 124 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 TECTBQ96PL2 329 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 ANXA10Q9UJ72 324 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 NUDT19A8MXV4 375 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 H0YIZ8 118 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 MASP2O00187 686 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 RBMXP38159 391 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 NKAPLQ5M9Q1 402 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 SGPP2Q8IWX5 399 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 POC1AQ8NBT0 407 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 OR2AE1Q8NHA4 323 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 FAM117AQ9C073 453 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 SPEGQ15772 3267 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 TRAPPC6AO75865 159 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 NRASP01111 189 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 B4GALT1P15291 398 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 NTF4P34130 210 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 NRN1LQ496H8 165 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 ZBTB44Q8NCP5 570 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 RNF141Q8WVD5 230 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 ROBO4Q8WZ75 1007 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 OR2H1Q9GZK4 316 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 LOXL2Q9Y4K0 774 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 CYTIPO60759 359 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 RFPL3SP0C7P2 107 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 RGS19P49795 217 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 RPS18P62269 152 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 PSG4Q00888 419 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 IL15RAQ13261 267 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 STK11Q15831 433 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 CT55Q8WUE5 264 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM100Q9NV29 134 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 IL36GQ9NZH8 169 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 SLC7A11Q9UPY5 501 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 FUT6P51993 359 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 HGFACQ04756 655 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 CEACAM16Q2WEN9 425 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 PXDC1Q5TGL8 231 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 AKR7LQ8NHP1 331 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM45BQ96B21 275 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 POM121Q96HA1 1249 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 CYYR1Q96J86 154 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 OR10C1Q96KK4 312 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 STRADBQ9C0K7 418 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 GPR35Q9HC97 309 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 CYTL1Q9NRR1 136 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 NECAP2Q9NVZ3 263 aa17.02■□□□□ 0.32
SPNS1-201ENST00000311008 TAAR5O14804 337 aa17.01■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 FARS2O95363 451 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 KNG1P01042 644 aa17.01■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 APOC3P02656 99 aa17.01■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 GDF1P27539 372 aa17.01■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 WNT5BQ9H1J7 359 aa17.01■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 PCDHB10Q9UN67 800 aa17.01■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 TERTO14746 1132 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 TSPAN4O14817 238 aa17.01■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 XRCC2O43543 280 aa17.01■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF883P0CG24 379 aa17.01■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 ZXDAP98168 799 aa17.01■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 BCO1Q9HAY6 547 aa17.01■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 ANGPTL7O43827 346 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 OR5H8P0DN80 308 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 CHATP28329 748 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 PTGER4P35408 488 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 GFRA1P56159 465 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 TAF9Q16594 264 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 DHRS11Q6UWP2 260 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 TAAR9Q96RI9 348 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 FAAP24Q9BTP7 215 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 P4HTMQ9NXG6 502 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 OR5AC2Q9NZP5 309 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 ATPIF1Q9UII2 106 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 AK3Q9UIJ7 227 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 MPTX1A8MV57 137 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 IFNA21P01568 189 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 RAB32Q13637 225 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF273Q14593 569 aa17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SPNS1-201ENST00000311008 BPIFCQ8NFQ6 507 aa17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms