RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290378.4

ACTC1-201, Transcript of actin, alpha, cardiac muscle 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTC1, Length 4,106 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1-201ENST00000290378 LIPGQ9Y5X9 500 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 DCDP81605 110 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 DNM1P34Q6PK57 102 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 SLC22A24Q8N4F4 322 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 IFI44Q8TCB0 444 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 OR5B12Q96R08 314 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 DKKL1Q9UK85 242 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa9.77□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 C9JQL5 133 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 KIR3DL2P43630 455 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 CLRN1P58418 232 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 ZNF880Q6PDB4 577 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 PRSS35Q8N3Z0 413 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 PRR18Q8N4B5 295 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 ARRDC1Q8N5I2 433 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 TMEM234Q8WY98 164 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 CABLES2Q9BTV7 478 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 OR14J1Q9UGF5 321 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 DOCK11Q5JSL3 2073 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 VSTM2BA6NLU5 285 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 CTLA4P16410 223 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 OR5I1Q13606 314 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 PRSS54Q6PEW0 395 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 ZNF429Q86V71 674 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 OTOSQ8NHW6 89 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 A0A087WUJ7 227 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 H0YL77 283 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 MFNGO00587 321 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 EFSO43281 561 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 FCGR2AP12318 317 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 CMTM3Q96MX0 182 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 PRRX2Q99811 253 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 VPS25Q9BRG1 176 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 PADI1Q9ULC6 663 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 R4GN57 208 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 A0A1W2PPQ1 181 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 CEBPZOSA8MTT3 80 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 KLF4O43474 513 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 CST4P01036 141 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 SPINK2P20155 84 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 ZBTB25P24278 435 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 TAF9Q16594 264 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 PRTGQ2VWP7 1150 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 LRRC18Q8N456 261 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 OR5L2Q8NGL0 311 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 TAAR8Q969N4 342 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 OR8B4Q96RC9 309 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 FANCMQ8IYD8 2048 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 UPK3AO75631 287 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 CD74P04233 296 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 ERGP11308 486 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 BMP5P22003 454 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 PLGLB1Q02325 96 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 NHLH2Q02577 135 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 UBE2V2Q15819 145 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 RTN4RL2Q86UN3 420 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 ZNF695Q8IW36 515 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 ASB5Q8WWX0 329 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 TSPAN32Q96QS1 320 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 CES1P1Q9UKY3 287 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 LAMP3Q9UQV4 416 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 NUDT19A8MXV4 375 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 H0YIZ8 118 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 DFFBO76075 338 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 PGA4P0DJD7 388 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 PGA5P0DJD9 388 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 MGAT2Q10469 447 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 ZNF345Q14585 488 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 MENTQ9BUN1 341 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 DDA1Q9BW61 102 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 RAB27BO00194 218 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 CYR61O00622 381 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 ANGPTL7O43827 346 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 TBX19O60806 448 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 RRADP55042 308 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 ELLP55199 621 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 PMS2P11Q13670 270 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 MESTQ5EB52 335 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 SLC46A1Q96NT5 459 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 MSL2Q9HCI7 577 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTC1-201ENST00000290378 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.7 ms