RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264694.12

SNX25-201, Transcript of sorting nexin 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SNX25, Length 3,264 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX25-201ENST00000264694 TMEM225BP0DP42 221 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 ZNF84P51523 738 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 TMEM92Q6UXU6 159 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 OR52M1Q8NGK5 317 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 PIGTQ969N2 578 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 PBDC1Q9BVG4 233 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 CHST5Q9GZS9 411 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 PLEKHA2Q9HB19 425 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 CHST11Q9NPF2 352 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 E5RGE8 158 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 H0YL77 283 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 RABIFP47224 123 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 P2RY1P47900 373 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 YPEL5P62699 121 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 HAGHQ16775 308 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 MYO7BQ6PIF6 2116 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 OGFOD3Q6PK18 319 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 PRO1933Q9H354 126 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 SUSD2Q9UGT4 822 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 NSG2Q9Y328 171 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 TRIOO75962 3097 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 CLRN1P58418 232 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 C1orf189Q5VU69 101 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 LANCL3Q6ZV70 420 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 COMMD1Q8N668 190 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 NAXEQ8NCW5 288 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 RAB39BQ96DA2 213 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 MUCL1Q96DR8 90 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 MEGF10Q96KG7 1140 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 DOCK8Q8NF50 2099 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 A0A1W2PQD3 144 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 THEGLP0DJG4 465 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 OMGP23515 440 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 CASP6P55212 293 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 OR5L1Q8NGL2 311 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 Q8WTZ3 238 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 DYRK2Q92630 601 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 GINS3Q9BRX5 216 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 GPR61Q9BZJ8 451 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 ARV1Q9H2C2 271 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 SERINC1Q9NRX5 453 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 FAM221AA4D161 298 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 H3BQ15 152 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 FCGR2AP12318 317 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 GALNSP34059 522 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 UCP2P55851 309 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 FBXW4P57775 412 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 FOXF1Q12946 379 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 BRICD5Q6PL45 260 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 DTX1Q86Y01 620 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 HPSE2Q8WWQ2 592 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 YPEL4Q96NS1 127 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 NELFAQ9H3P2 528 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 CUTCQ9NTM9 273 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 COPS7AQ9UBW8 275 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 SPAG17Q6Q759 2223 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 GPR137BO60478 399 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 POU2F2P09086 479 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 FAHP16930 419 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 RGS19P49795 217 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 RAB1AP62820 205 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 GABREP78334 506 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 CHAF1BQ13112 559 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 FZD2Q14332 565 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 TMEM240Q5SV17 173 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 C20orf196Q8IYI0 205 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 NTNG2Q96CW9 530 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 C14orf144Q96I85 54 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 S100A13Q99584 98 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 CFHR5Q9BXR6 569 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 ZNF700Q9H0M5 742 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa11.61□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 MSTNO14793 375 aa11.61□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 OR5H8P0DN80 308 aa11.61□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 NDUFB7P17568 137 aa11.61□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 PRSS12P56730 875 aa11.61□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 UBE2KP61086 200 aa11.61□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 FBXW12Q6X9E4 464 aa11.61□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 FAM89BQ8N5H3 189 aa11.61□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 ZNF610Q8N9Z0 462 aa11.61□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 CCDC54Q8NEL0 328 aa11.61□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 OIT3Q8WWZ8 545 aa11.61□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 PRDM13Q9H4Q3 707 aa11.61□□□□□ -0.55
SNX25-201ENST00000264694 ZNF850A8MQ14 1090 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms