RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 MSX1P28360 303 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 DAP3P51398 398 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 QRFPP83859 136 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SRYQ05066 204 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 MRGPRFQ96AM1 343 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SCGB3A2Q96PL1 93 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 MMP26Q9NRE1 261 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC5A6Q9Y289 635 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM25EA8MYX2 175 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 EFNA2O43921 213 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 HFEQ30201 348 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 WDYHV1Q96HA8 205 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CNTD2Q9H8S5 307 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CEACAM18A8MTB9 384 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 PRRG2O14669 202 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CSN2P05814 226 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CLDN15P56746 228 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 STK11Q15831 433 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 BEX5Q5H9J7 111 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 RTL6Q6ICC9 239 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 HOGA1Q86XE5 327 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SARAFQ96BY9 339 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 GAL3ST1Q99999 423 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ANAPC10Q9UM13 185 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL21O00585 134 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 H2BFMP0C1H6 154 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 LYL1P12980 280 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 VAMP1P23763 118 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 LHX2P50458 406 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXF1Q12946 379 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM128Q5BJH2 165 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 POMZP3Q6PJE2 187 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 DCXRQ7Z4W1 244 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ARRDC1Q8N5I2 433 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CHST4Q8NCG5 386 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 OR1M1Q8NGA1 313 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF133Q8WVZ7 376 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXN4Q96NZ1 517 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC11CQ9BY50 192 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB18Q9NP72 206 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 C5orf51A6NDU8 294 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BML4 177 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 HRH1P35367 487 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 NKAPLQ5M9Q1 402 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10K2Q6IF99 312 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5D14Q8NGL3 314 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10R2Q8NGX6 335 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM234Q8WY98 164 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM215AQ9Y5M1 114 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A9P48067 706 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 VAX1Q5SQQ9 334 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 LDLRAD3Q86YD5 345 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 DCUN1D4Q92564 292 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 HEXAP06865 529 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 PGAM2P15259 253 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 CLDN18P56856 261 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 C4orf17Q53FE4 359 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF529Q6P280 563 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD9Q7L273 389 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 TERB2Q8NHR7 220 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 ASB10Q8WXI3 467 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 WIPF3A6NGB9 483 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 S100A12P80511 92 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 UNC119Q13432 240 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL24Q6TFL4 600 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 RHOUQ7L0Q8 258 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 PRDM14Q9GZV8 571 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 BIN3Q9NQY0 253 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 MEMO1Q9Y316 297 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 PQLC2LA1A4F0 135 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM14DPA8MWL7 114 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 FTCDNL1E5RQL4 147 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 F8W036 122 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR31O00270 319 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTL6AO96019 429 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 PET100P0DJ07 73 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 VSIG8P0DPA2 414 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 AKR1C4P17516 323 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINF1P36955 418 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-201ENST00000246533 BLOC1S1P78537 153 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms