RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1109Q2LD37 5005 aa13.1□□□□□ -0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 ZNF878C9JN71 531 aa13.04□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 DENRO43583 198 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
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SPCS1-201ENST00000233025 POU1F1P28069 291 aa13.04□□□□□ -0.32
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