RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Taf13P61216 124 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 A230072I06RikQ3UUJ8 172 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Opa3Q505D7 179 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NmsQ5H8A1 153 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ovch2Q7M761 609 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sez6Q7TSK2 991 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fmr1nbQ80ZA7 238 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hyal5Q812F3 526 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sh2d7Q8BI17 458 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tnfsfm13Q8BXS2 410 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr1504Q8VFQ4 315 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tpra1Q99MU1 369 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mdp1Q9D967 164 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Alg5Q9DB25 324 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tnfrsf19Q9JLL3 416 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Psma6Q9QUM9 246 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lhx6Q9R1R0 363 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fbxw27A0A1D5RLF0 466 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ndufaf6A2AIL4 333 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmem8bB1AWJ5 472 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ms4a18J3QN01 344 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lin7bO88951 207 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 RpiaP47968 303 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Scand1Q2M4I6 142 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 ScimpQ3UU41 150 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Grb2Q60631 217 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tm7sf2Q71KT5 418 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adam20Q7M763 760 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sp110Q8BVK9 445 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lrtm1Q8BXQ3 356 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tgm4Q8BZH1 670 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rps19bp1Q8C6B9 143 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Klf11Q8K1S5 502 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sf3b4Q8QZY9 424 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rdh10Q8VCH7 341 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cisd2Q9CQB5 135 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 FetubQ9QXC1 388 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mmp16Q9WTR0 607 aa15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 SpenQ62504 3644 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr1107A2AVB8 312 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adamts3E9Q287 1204 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Yjefn3F6W8I0 251 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 D430019H16RikJ3QPM6 83 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PtcraP0C6B2 199 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lire1P11260 357 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 KitlgP20826 273 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dynlrb1P62627 96 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arf1P84078 181 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc25a26Q5U680 274 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr804Q7TRH7 314 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr304Q7TS03 333 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr285Q7TS17 319 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fbxo5Q7TSG3 421 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pld4Q8BG07 503 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc1a7Q8JZR4 559 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr54Q8VFE6 313 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmem42Q9CR22 157 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tex12Q9CR81 123 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mrps14Q9CR88 128 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 SdhcQ9CZB0 169 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Izumo1Q9D9J7 397 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tas2r105Q9JKT4 300 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Shank1D3YZU1 2167 aa15.93■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm14409A2ARR8 349 aa15.92■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr585E9PXW4 318 aa15.92■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm21750L7N228 499 aa15.92■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Itgb2P11835 771 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gpm6aP35802 278 aa15.92■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc7a10P63115 530 aa15.92■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfp974Q3UVF6 752 aa15.92■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc38a8Q5HZH7 432 aa15.92■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Foxg1Q60987 481 aa15.92■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr1500Q7TQQ3 311 aa15.92■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cdhr3Q8BL00 831 aa15.92■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 ArsjQ8BM89 598 aa15.92■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 C330021F23RikQ8C7T0 141 aa15.92■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Myct1Q8R411 188 aa15.92■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Il25Q8VHH8 169 aa15.92■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mob1aQ921Y0 216 aa15.92■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Washc3Q9CR27 194 aa15.92■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc15a1Q9JIP7 709 aa15.92■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vmn1r82A0A087WRV1 305 aa15.91■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm13178B1AVU7 408 aa15.91■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc18b1D3Z5L6 459 aa15.91■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr1511E9PWU0 318 aa15.91■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr1510E9PZZ6 318 aa15.91■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm20834J3QM72 227 aa15.91■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kcnj1O88335 372 aa15.91■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 UbcP0CG50 734 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Camk2bP28652 542 aa15.91■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CtdsplP58465 276 aa15.91■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Bcl2l2P70345 193 aa15.91■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ankrd33bQ3U0L2 486 aa15.91■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lcn4Q62472 185 aa15.91■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rab35Q6PHN9 201 aa15.91■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Plppr1Q8BFZ2 325 aa15.91■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NdnfQ8C119 568 aa15.91■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rnf121Q8R1Z9 327 aa15.91■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 TbccQ8VCN9 341 aa15.91■□□□□ 0.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr678Q8VG26 313 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.9 ms